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生物学
肠道病毒EV71型浙江分离株HZ08全基因组序列分析
目的了解浙江省流行的肠道病毒71型HZ08株的基因特征,研究肠道病毒71型的进化及变异状况。方法设计特异性引物,RT-PCR扩增HZ08株全基因,PCR产物纯化后克隆于T载体并进行序列测定和基因进化分析。结果 HZ08株的全基因组由7 405个核苷酸组成,编码2193个氨基酸。HZ08的5非编码区(UTR)、VP1、VP2、VP3、VP4、P2、P3、3非编码区(UTR)和全基因组的核苷酸与C4亚型的毒株序列较高,分别为96.2%~99.1%,92.6%~99.1%,92.7%~98.4%,88%~99.2%,93.8%~99.5%,89.4%~99.2%,91.4%~98.8%,87.8%~100%和91.1%~98.9%。HZ08株与其他亚型各区段的核酸同源性均低于90%。根据VP1基因和全基因序列进行种系统发生分析显示HZ08株与中国陆和台湾的病毒进化关系较近,与国际标准株以及东南亚毒株进化关系统较远。其中HZ08株与国内流行株BJ08和Fuyang08的进化关系最近。HZ08株与C4亚型相关氨基酸序列一致,VP1的抗原性表位发生了变异。结论 HZ08病毒分离株为C4亚型,与Fuyang08和BJ08株进化途径相同,为肠道病毒71型的基因组功能学和疫苗学研究奠定基础。
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中国人兽共患病学报
2011年08期

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