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畜牧与动物医学
基于绵羊皮肤组织ESTs开发新型微卫星标记
利用生物信息学方法,在从国际公共生物数据库检索获得绵羊皮肤组织相关的3295条EST序列中筛选微卫星标记。结果表明,从绵羊皮肤组织相关的EST序列中搜索到微卫星209个,含有微卫星的序列196个,占整个EST序列数据库的6.3%,其中双碱基重复150个,三碱基重复19个,四碱基重复12个,五碱基重复17个,六碱基重复11个。在这些微卫星序列中,AC/TG重复在双碱基类型中最丰富,占双碱基微卫星序列总数的67%。根据筛选到的微卫星序列设计并合成引物22对,其中18对引物有扩增产物,且条带清晰,6对引物在中国美利奴羊群内多态性丰富,平均PIC达0.7001,为后期与毛品质进行相关性分析,寻找毛用性状新型分子标记奠定了基础。
领 域:
关键词:
绵羊皮肤ESTSSR
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中国农学通报
2010年03期

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