在科研院所建立现代企业制度和现代科研院所制度是我国科研院所制度改革的两种基本取向。现代科研院所制度作为一种独立的组织制度,其内涵是由其协调的各种经济关系诸多发展方面的"现代性"所决定的,具体表现为现代科研院所体系的"现代性"等五个方面。现代科研院所制度的外延是指作为和现代企业制度一样的独立的组织制度,具有可移植性,对于主要采用现代企业制度的科研院所,在某种特殊情况和特别环境下,仍然有现代科研院所制度发挥作用的余地和空间。准确阐释现代科研院所制度的内涵,相应拓展其外延是建立现代科研院所制度,并推进传统科研院所体制改革的首要任务。