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环境科学与资源利用
砷氧化菌株的筛选及Bosea sp. AS-1基因组分析
【目的】对湖南省锡矿山中的砷氧化菌株的种属进行初步鉴定,并对砷锑氧化菌株Bosea sp. AS-1(简称AS-1)进行全基因组测序和生物信息学分析。【方法】纯化分离砷氧化菌株,并利用16S rRNA基因测序进行菌种鉴定。在此基础上,对能够高效氧化砷的菌株AS-1进行全基因组测序,对测序数据进行基因组装和功能注释、COG、GO及KEGG聚类分析,以及次级代谢产物合成基因簇与代谢途径预测等。【结论】湖南省锡矿山的砷氧化菌株主要分布在α-、β-、γ-变形菌纲以及厚壁菌门。菌株AS-1基因组的测序结果显示AS-1基因组包含一条大小为5.536 Mb环状染色体和两个大小分别为189.9 kb和112.1 kb的质粒。对AS-1基因组进一步分析发现该菌株的基因组中包含砷锑代谢相关基因,还有鞭毛形成、鞭毛运动及生物膜形成的基因,这些基因的存在可能与AS-1能高效耐受和氧化砷和锑的特性相关。此外,菌株AS-1中还存在部分碳固定基因和硫氧化基因,这暗示着AS-1能够进行自养生长并氧化环境中的硫元素的可能性。初步的实验证明,菌株AS-1可以在自养条件下生长并且能够氧化Sb(Ⅲ)为Sb(Ⅴ)。
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微生物学报
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