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蛋白质序列复杂性简化与非比对序列分析
南京大学物理系固体微结构物理国家重点实验室,南京大学物理系固体微结构物理国家重点实验室,南京大学物理系固体微结构物理国家重点实验室 南京210093,南京210093,南京210093
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李菁
李逢博
王炜
非比对序列分析是最新发展的一种序列分析方法,具有计算效率高并适用于分析低相似性的序列,已成功用于DNA的序列分析中.但是由于蛋白质序列的复杂性,非比对序列分析对于蛋白质序列分析的准确度却不高.用将20种天然氨基酸残基归类的方法,简化了蛋白质序列的复杂性,并运用到对蛋白质的非比对序列分析中,有效地提高了序列分析的准确性.
机 构:
南京大学物理系固体微结构物理国家重点实验室,南京大学物理系固体微结构物理国家重点实验室,南京大学物理系固体微结构物理国家重点实验室 南京210093,南京210093,南京210093;
领 域:
生物学
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关键词:
非比对序列分析
;
氨基酸残基归类
;
序列复杂性简化
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格 式:
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生物化学与生物物理进展
2006年12期
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