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农业基础科学
芽胞杆菌TS01的扩增核糖体DNA限制性分析(ARDRA)评估和遗传分析
利用自主分离的芽胞杆菌菌株TS01和15种芽胞杆菌(地衣芽胞杆菌(Bacillu.licheniformis)、枯草芽胞杆菌(B.subtilis)、短小芽胞杆菌(B.pumilus)、巨大芽胞杆菌B(.megaterium)、凝结芽胞杆菌(B.coagulans)、蜡状芽胞杆菌(B.cereus)、迟缓芽胞杆菌(B.lentus)、苏云金芽胞杆菌(B.thuringiensis)、嗜热脂肪芽胞杆菌(B.thermoaerophilus)、解淀粉芽胞杆菌(B.amyloliquefaciens)、环状芽胞杆菌(B.circulans)、球形芽胞杆菌(B.sphaericus)、侧胞短芽胞杆菌(Brevibacillus laterosporus)、多粘类芽胞杆菌(Paenibacillus polymyxa)和泛酸枝芽胞杆菌(Virgibacillus pantothenticus))模式菌种进行扩增核糖体DNA限制性分析(ARDRA)。采用16SrDNA通用引物16S-27和16S-1525进行PCR扩增,16SrDNA扩增片段经6种限制性酶(AluⅠ、TaqⅠ、MseⅠ、BstUⅠ、HhaⅠ和Tsp509Ⅰ)酶切电泳,获得了TS01菌株的特征性ARDRA指纹图谱。ARDRA图谱通过GelcomparⅡ软件进行聚类分析(UPGMA),结果表明,菌株TS01和地衣芽胞杆菌处于同一分支,亲缘关系最近。ARDRA分析鉴定结果与实验室前期菌株TS01形态、生化鉴定和16SrDNA序列分析结果一致,TS01是1株地衣芽胞杆菌菌株,从而证明ARDRA技术在菌种水平上对芽胞杆菌TS01进行鉴别具有可靠性。
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农业生物技术学报
2009年06期

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