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滇黄精转录组测序及类黄酮合成相关基因的分析
为了丰富滇黄精不同器官发育的转录组数据,筛选参与类黄酮生物合成的关键基因,对滇黄精根、茎和叶进行转录组测序,并对参与类黄酮生物合成的差异基因进行筛选分析。转录组测序共获得219 769条unigenes,平均长度502.31 bp,N50为627 bp。通过数据库(NR、eggNOG、Pfam、Swiss-Prot、KEGG、GO、KOG、COG)对unigenes进行功能基因注释,分别有76 179、67 055、45 508、35 287、26 259、39 479、43 295和24 524条unigenes获得注释。基于转录组测序分析,筛选出10个与滇黄精类黄酮生物合成相关的差异基因,通过qRT-PCR检测差异基因在滇黄精不同器官中的表达水平,并与类黄酮含量进行相关性分析,确认CHI和CHS是滇黄精类黄酮生物合成途径中的关键基因,其基因的表达量决定了类黄酮的合成量。
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河南农业大学学报
2020年06期
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