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肿瘤学
基于外周血细胞基因表达谱筛选检测胃癌的差异表达基因
目的分析胃癌患者外周血细胞基因表达谱特征,筛选检测胃癌的差异表达基因。方法对21名胃癌患者和21名健康对照者外周血样本进行RNA测序,利用生物信息学方法获取胃癌的基因表达谱特征。从胃癌的差异表达基因中筛选候选基因,利用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)技术在25名胃癌患者和48名健康对照者外周血样本中进行验证。使用受试者工作特征曲线(ROC)和Logistic回归分析评估差异表达基因筛查胃癌的潜力。结果在胃癌患者与健康对照者外周血测序样本中检测到1258个差异表达基因(642个基因上调,616个基因下调)。经过滤后选择差异最显著的30个基因在新样本中进行qRT-PCR验证,其中3个基因(C1QB、MMP9和SMIM1)仍然具有差异性。Logistic回归分析显示3个基因联合鉴别胃癌的灵敏性为92%,特异性为72. 92%,ROC曲线下面积为0. 8708。结论胃癌患者外周血细胞基因表达谱发生显著改变,并发现3个差异表达基因在新样本中仍然具有差异性。该研究为检测胃癌提供了一种有前途的非侵入性qRT-PCR方法。
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军事医学
2018年10期

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