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生物学
肝细胞癌中异常甲基化差异表达基因的生物信息学分析
肝细胞癌是全球常见的高死亡率癌症之一,为找到可以作为其诊断和治疗的生物标志物,通过GEO数据库中的相关数据分析,获取异常甲基化差异表达基因;其中,甲基化下调表达上调的交集基因68个,甲基化上调表达下调的交集基因59个.对所获取的基因进行功能和通路富集分析,进而阐明与肝细胞癌相关的生物学功能及通路;构建蛋白互作网络并对其进行可视化,然后根据连接度筛选出10个hub基因,通过TCGA数据库验证后得到其中7个hub基因(ITPR1、ITGB1、UBR4、DYNC1、ANK1、PRKCA和NTRK2)更具可信度,可作为未来肝细胞癌精准诊断和治疗的异常甲基化生物标志物.
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河南大学学报(自然科学版)
2022年01期
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