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畜牧与动物医学
六个地方鸡品种遗传结构及其MHC基因的遗传变异研究
我国家禽品种资源丰富,但近年来受到外来引进鸡品种的冲击,导致我国地方鸡品种群体数量日益减少。对家禽遗传资源的研究有助于了解品种资源的现状和特色,为品种资源的评价、保护和合理开发利用打下良好基础。鸡主要组织相容性复合体(major histocompatibility complex,MHC)是指16号染色体上的一组紧密连锁、高度多态的基因群编码的特异性蛋白,位于该染色体MHC B区的基因群包括B-F(Ⅰ类),B-L(Ⅱ类),B-G(Ⅳ类)三个基因座。研究表明,MHC基因多态性与家禽对多种传染病的抗性高度相关,是家禽抗病育种研究中的优选标记基因。本研究选取藏鸡、文昌鸡、固原鸡、略阳鸡、陕北鸡和太白鸡等6个地方鸡品种共584个个体作为实验材料,利用微卫星和PCR-SSCP标记技术,对6个品种的遗传结构和MHC基因在群体内的遗传变异进行分析。研究结果如下: 利用20个微卫星位点对6个地方鸡品种遗传结构进行分析,6个群体的平均等位基因数为4.9802,平均有效等位基因数为3.5464。其中,LEI0073位点等位基因最多,为12个,MCW0351和MCW0287等位基因最少,均为4个。通过哈代-温伯格平衡检验,除MCW0287、MCW0264、MCW0145和MCW0104位点外,其它位点均有群体显著偏离哈代-温伯格平衡。六个群体的平均杂合度均值为0.6717,其中藏鸡的平均杂合度最高,为0.7138,显示该品种遗传变异程度最高,遗传多样性最丰富,该品种在未来还可以进一步加大纯繁选育力度,以提高品种的遗传一致性。各群体平均多态信息含量的范围是0.5445(陕北鸡) ~0.6694(藏鸡),均大于0.5,表现为高度多态性,表明本研究所用的20个微卫星位点能够有效地应用于分析品种的遗传变异。 采用PCR-SSCP结合序列测定的方法,检测了MHC B-LBⅡ基因第二外显子在6个地方鸡群体中的遗传变异: (1)六个品种中共检测到3种基因型,分别命名为AA型、BB型和AB型。除藏鸡群体外,AA型频率在5个鸡群体中均较高, A等位基因频率高于B等位基因频率,因此推测A等位基因为优势等位基因;Hardy-Weinberg平衡性检验结果表明所有群体均处于不平衡状态(P<0.01)。 (2)测序结果发现在176 bp的核苷酸序列中有11个变异位点,约占分析位点的6.25%,同义突变2个,其中非同义突变9个;编码的58个氨基酸中有5个氨基酸发生改变,氨基酸序列的同源性低于核苷酸序列的同源性。 (3) MHC B-LBⅡ基因在各品种内的杂合度(He)在0.1420~0.4977之间,藏鸡最高;多态信息含量(PIC)处于0.1319~0.3738之间,藏鸡最高,表明该品种的遗传资源比较丰富。 本研究结果可为我国地方鸡品种的种质特性研究提供基础性数据,为地方鸡品种资源的合理保护和利用提供科学依据。
硕士论文
《西北农林科技大学》 2008年硕士论文

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