本文从方法论层次上对以老制度学派为代表的演化经济学企业理论和马克思主义企业理论进行了比较。老制度学派企业理论以整体主义方法论为基础;而马克思主义企业理论则是以唯物史观和唯物辩证法作为根本方法。老制度学派企业理论以“制度人”作为研究的出发点;而马克思主义企业理论则以历史的、现实的人作为研究的出发点。老制度学派采用进化论方法,把企业问题置于文化领域中研究;而马克思主义者则运用系统发展的观点,在生产与交换的有机结合中研究企业问题。本文认为从根本上看,马克思主义企业理论方法论更具科学性和指导性。