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登革2型病毒04株基因组全序列的测定

杨敬;杨佩英;秦鄂德;胡志君;于曼;欧武

  目的 对我国登革 2型病毒 0 4株 (D20 4)基因组进行全序测定及分析 ,为了解其基因组结构与生物功能的关系及研究开发登革病毒新型疫苗奠定基础。方法 根据登革 2型国际标准株NGC的序列 ,设计 13对重叠引物 ,通过RT PCR扩增出D20 4株不同的cDNA片段 ,分别克隆到pGEM T载体 ,转化受体菌DH5α ,挑取阳性克隆进行PCR、酶切鉴定及序列测定。结果 D20 4株的基因组全长 10 72 3个碱基 ,从 97到 10 2 6 9位为一个长的开放读码框 ,编码 3391个氨基酸。将它与其它登革 2型病毒株NGC、JAM、PR15 9(S1)、16 6 81及它的候选疫苗株PDK 5 3进行比较 ,其核酸序列同源性分别为 95 .0 %、97.6 %、89.8%、93.8%和 93.7% ,氨基酸序列的类似性分别为 97.8%、98.6 %、96 .7%、97.6 %和 97.5 %。结论 我国D20 4株的基因组全序列基本类似于已发表的其它登革 2型病毒株。在比较的 5株登革 2型病毒株中 ,D20 4株更类似于JAM株 ,其次是NGC株 ,与S1株的类似性略低。比较的结果表明 ,D20 4株与JAM株紧密相关 ,它们可能属于同一拓扑型。D20 4株全序的测定 ,对分析我国毒株来源及研制适于我国人群的登革疫苗具有一定意义。……   
[关键词]:登革2型病毒;基因组;序列分析
[文献类型]:期刊
[文献出处]: 《中华微生物学和免疫学杂志2000年03期
[格式]:PDF原版; EPUB自适应版(需下载客户端)