手机知网 App
24小时专家级知识服务
打 开
手机知网|搜索

羊轮状病毒NT株VP1基因的测序和分子进化分析

陈艳君;朱伟文;隋硕;张晓伟;胡松年

  【目的】为了研究羊轮状病毒NT株VP1基因的遗传进化规律,【方法】根据GenBank中相关VP1基因的保守序列,设计合成引物,扩增NT株VP1基因并进行克隆测序和序列分析。【结果】氨基酸序列比较表明NT株与其他毒株VP1基因的相似性为77.3%~98.4%,且氨基酸突变多发生在VP1蛋白的非功能区。VP1蛋白进化树表明NT株与牛轮状病毒处于同一进化分支,有较近的亲缘关系。结合26株具有代表性的轮状病毒,计算毒株间VP1基因的核苷酸和氨基酸进化距离,并对核苷酸的同义突变率(dS)和非同义突变率(dN)进行研究,发现dN/dS的比值小于1,说明同义替代是VP1基因在进化过程中的主要变异。【结论】本文首次对羊轮状病毒NT株进行了VP1基因的测序,并对VP1基因的进化距离和进化规律进行深入探讨。……   
[关键词]:羊轮状病毒NT株;VP1基因;序列联配;进化距离
[文献类型]:期刊
[文献出处]: 《微生物学报2009年08期
[格式]:PDF原版; EPUB自适应版(需下载客户端)