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鸭肠炎病毒核衣壳蛋白密码子偏爱性分析

高颖;代淑燕;张荷;程振涛;周碧君;文明

  为给鸭肠炎病毒(DEV)核衣壳蛋白(NP)基因选择良好的宿主表达系统提供参考依据,本研究运用EM-BOSS软件包CHIPS和CUSP程序对DEVNP基因进行了密码子偏爱性分析。结果显示,DEV NP基因的ENC值为51.180,编码NP蛋白的A、I等氨基酸不同密码子的使用频率存在一定的差异;从与DEV NP基因密码子使用频率比值上看,大肠杆菌22个、酵母18个、鸭12个和人20个密码子存在较大的偏爱性。由此可见,编码DEVNP蛋白密码子出现频率较均一,且酵母等真核生物与其密码子偏爱性较为接近,可作为该基因体外表达宿主的首选。……   
[关键词]:鸭肠炎病毒;核衣壳蛋白;密码子偏爱性
[文献类型]:期刊
[文献出处]: 《山地农业生物学报2011年02期
[格式]:PDF原版; EPUB自适应版(需下载客户端)