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两株中国腮腺炎野毒SH基因cDNA直接测序和克隆测序

武力;白植生;李益民;周旭;宁小军;杨朝晖

  对来源于兰州和上海两市的两株腮腺炎病毒野毒的小疏水蛋白(SH)基因及其旁侧区cDNA的PCR扩增产物,分别进行直接测序和克隆测序。用直接测序法测定2株腮腺炎野毒378个核苷酸序列,在此范围内存在16个核苷酸(4.2%)差异,其中11个(2.9%)位于编码区序列中,所推导的SH蛋白序列有6个氨基酸(10.5%)差异。克隆测序法测定的这两株腮腺炎野毒的核苷酸序列相当于直接法的78-378位核苷酸。两种方法在所测301个核苷酸(nt)的共同区域内序列完全一致。证明PCR产物直接测序用于腮腺炎病毒分子流行病学研究不仅特异性强,敏感度高,而且比克隆测序法更为快速简便,节省材料……