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新疆地方鸡品种MHC-B-F遗传多样性的研究

肖白桦

   吐鲁番斗鸡和拜城油鸡是新疆知名的两个地方家禽品种。吐鲁番斗鸡形成于新疆吐鲁番地区,为中国著名的斗鸡品种。拜城油鸡产于著名的龟兹文化发祥地-新疆阿克苏地区拜城县,其起源进化方面的研究尚存在空白。鸡主要组织相容性复合体是指16号染色体上的一组紧密连锁的、高度多态的基因座所组成的一个遗传区域,是一个与免疫应答和抗病性密切相关的多基因家族。本研究对吐鲁番斗鸡和拜城油鸡的MHC B-F基因第二外显子区域和线粒体DNA D-loop区进行序列测定,结合下载序列,结果如下: (1)新疆地方鸡品种69个个体中共有62个单倍型,单倍型多样性指数为0.994。在MHC B-F基因第二外显子区域264bp片段长度范围内多态性变异位点数目59个,其中单一多态位点5个,简约信息位点54个,核苷酸多态性值为0.6977。核苷酸异义替换率为8.08%±1.62%,同义替换率为5.49±0.84%。 (2)新疆地方鸡MHC B-F基因外显子2的DNA序列具有丰富的多态性,但其多态性位点的分布并不均匀。该序列所编码的88个氨基酸序列中,新疆地方鸡中有30个残基发生改变,DNA序列的同源性(205/264)高于氨基酸序列(58/88),表明其序列多态性更多的在氨基酸水平上表现。且无论是在DNA水平上,还是在氨基酸水平上,拜城油鸡(56/264,29/88)多态性均高于吐鲁番斗鸡(49/264,27/88)。 (3)对吐鲁番斗鸡、拜城油鸡各13个个体mtDNA的D-loop区(512bp)的序列分析共发现21个变异位点,26个个体中共有10个单倍型,单倍型多样性指数为0.905。自数据库下载25种中国地方品种鸡、1种中国红原鸡、1种印度红原鸡和韩国日本本地鸡各1种,合计59个个体序列。把85个鸡品种个体mtDNA D-loop区的序列综合在一起分析,共发现33处变异位点,25种单倍型。新疆地方鸡品种mtDNA D-loop区基因遗传多样性较低,吐鲁番斗鸡和拜城油鸡之间存在着明显的基因交流,吐鲁番斗鸡可能是拜城油鸡育种母本之一,而多个地方鸡品种参与了吐鲁番斗鸡的形成过程。……   
[关键词]:吐鲁番鸡;拜城油鸡;组织相容性复合体;线粒体DNA
[文献类型]:硕士论文
[文献出处]:新疆大学2010年