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鸡PRL-R基因多态性与就巢和产蛋性状的关联研究

李丛艳

   一般认为,就巢会降低产蛋性能,但也存在相反的结论。本试验收集300日龄宁都三黄鸡的产蛋和就巢性状,以分析二者之间的相关性。大量研究表明,催乳素是禽类就巢起始和维持的关键激素,通过与其受体的特异性结合,调节就巢过程中的一系列生理生化反应。本试验采用候选基因法对催乳素受体基因的SNPs与就巢和产蛋性状进行关联研究。 鸡就巢和产蛋性状的相关分析表明,二者间呈极显著相关(P<0.01):开产晚的鸡具有更强的就巢倾向,不就巢的鸡300日龄平均产蛋量比就巢鸡高38.49个,就巢鸡300日龄畸形蛋量比不就巢的鸡少1.67个。就巢天数对开产日龄和300日龄畸形蛋量的影响不显著,而与300日龄产蛋量呈极显著负相关(r=-0.789,P<0.01),说明就巢天数是影响300日龄产蛋量的主要因素。 试验设计了10对引物,采用PCR-SSCP方法,扩增了PRL-R基因部分外显子及邻近内含子序列,检测到4个多态位点:分别为外显子3处的SNP1(A10862G,位于5 -UTR)、外显子6处的SNP2(A25670G,为同义突变)、内含子8处的SNP3(G30716A)以及外显子10处的SNP4(A31900G,导致PRL-R蛋白第628位天冬酰胺突变为丝氨酸)。生物信息学分析发现SNP4中A到G的突变引起一个Sox5(92分)和一个GATA-1(91分)转录因子结合位点的丢失:蛋白质结构预测分析发现第628位氨基酸的变异可能对PRL-R高级结构的影响不大,表明该位点的变异可能是在转录水平而非蛋白水平发挥作用。4个SNPs在5个本地鸡种(固始鸡、旧院黑鸡、新扬州鸡、山地乌骨鸡以及宁都三黄鸡)中的分布差异都达到了极显著水平,大部分位点在群体中的多态信息含量表现为中度多态。5个研究群体中产蛋量最高和就巢频率最小的新扬州鸡中优势基因型分别为D-型、F-型和H-型,而其它鸡种分别为C-型、E-型以及G-型(除宁都三黄鸡的SNP4中优势基因型为H-外)。 x~2检验结果显示SNP4与就巢频率极显著相关(P<0.01),H-型个体的就巢频率(58.49%)极显著地高于G-型(46.95%),差异达到11.54%;4个变异位点与就巢天数的关联分析显示,SNP4显著影响就巢天数(P<0.05),G-型(8.33d)极显著地高于H-型(5.93d),差异为2.4d。4个变异位点与产蛋性状的关联分析结果显示:SNP2显著影响300日龄产蛋量(P<0.05),D-型(116个)比C-型(113.62个)平均高2.4个蛋;SNP3显著影响开产日龄(P<0.05),E-型(136.26d)平均开产日龄晚于F-型(133.83d)近3d;SNP4影响300日龄产蛋量(P<0.05),H-型(117.31个)比G-型(112.24个)平均约多产5个蛋。这一结果与新扬州鸡中优势基因型的分布吻合。进一步构建6种单倍型进行关联分析,结果显示不同单倍型极显著地影响开产日龄(P<0.01):Z4型与Z1、Z2、Z8以及Z10型间的平均开产日龄差异极显著(P<0.01),与Z5型间的平均开产日龄差异显著(P<0.05);Z5型与Z1型间的平均开产日龄差异显著(P<0.05),其它各型之间差异不显著。含D-F-H的单倍型Z8型比含C-E-G的单倍型Z1型的开产早、产蛋量多、就巢天数少,这与单个基因位点变异的效应以及扬州鸡中优势基因型的分布都一致,表明SNP2、SNP3以及SNP4这三个多态位点与鸡的就巢和产蛋性状相关,是较好的分子标记。 研究结果表明开产晚的鸡具有更强的就巢倾向,就巢天数与产蛋量呈现出极显著的负相关。PRL-R基因的变异位点与性状的关联分析显示,其SNPs(尤其是SNP2-SNP3-SNP4)与就巢和产蛋性状存在显著或极显著相关,表明PRL-R基因可能是影响就巢和产蛋性状的一个重要候选基因。……   
[关键词]:;就巢;产蛋;催乳素受体;SNP
[文献类型]:硕士论文
[文献出处]:四川农业大学2009年