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芜菁花叶病毒与烟草脉带花叶病毒全基因组序列测定及分析

王红艳

   芜菁花叶病毒(Turnip mosaic virus,TuMV)、烟草脉带花叶病毒(Tobacco vein banding mosaic virus,TVBMV)和甜菜花叶病毒(Beet mosaic virus,BtMV)均为世界性分布的病毒,分别是危害十字花科蔬菜、茄科作物和藜科植物的主要病毒。本研究克隆了2个TuMV分离物和1个TVBMV分离物的全基因组序列,分析了这2种马铃薯Y病毒属病毒的分子变异情况,并首次报道了BtMV能自然侵染莴苣。 芜菁花叶病毒(TuMV): 从山东泰安和潍坊的萝卜上分离得到2个TuMV分离物WFLB06和TANX2,测定了它们的全基因组序列。生物学实验表明2个TuMV分离物均属于BR致病型,能同时侵染芸薹属和萝卜属植物,系统进化树分析表明它们均属于basal-BR组,这是中国basal-BR组分离物全基因组序列的首次报道。 通过RDP重组软件进行分析,发现这2个TuMV分离物均存在多次重组。其中WFLB06分离物是发生在P1基因、NIb基因和CI基因上的basal-BR与Asian-BR谱系间的重组,TANX2分离物是发生在P1基因、6K2基因、VPg基因上的basal-BR谱系内的重组。而且,这2种重组类型均是与先前报道的37种类型不同的新的重组类型。 核苷酸及氨基酸的一致率比较发现,中国和日本分离物来源于相同的种群,中国的TuMV basal-BR组的分离物可能来源于日本。分析中国TuMV分离物的遗传多样性,发现中国TuMV分离物的编码区在进化过程中氨基酸非常保守,处于负向或纯化选择。 烟草脉带花叶病毒(TVBMV): 本研究获得了我国烟草脉带花叶病毒主流株系代表分离物HN39的全基因组序列,HN39的全基因组序列为9570个核苷酸,这是世界上获得的TVBMV的第二个全基因组序列。 TVBMV-HN39全基因组序列与水茄花叶病毒(Wild tomato mosaic virus,WTMV)一致率最高,基因组的不同区段与不同马铃薯Y病毒属病毒的相应区段有最高的序列一致率,说明TVBMV-HN39的不同基因可能由不同的祖先进化而来。 甜菜花叶病毒(BtMV): 从泰安郊区菜田中表现花叶、矮化的莴苣病株上得到病毒分离物SD,血清学检测结果表明SD分离物是马铃薯Y病毒属病毒。利用马铃薯Y病毒属病毒的简并引物,通过RT-PCR技术获得了其3′-端约1.7 kb片段。Blast分析证明该分离物为BtMV。Western blotting结果进一步证实了这一结论。BtMV-SD与其它BtMV分离物3′-端基因序列的一致率为91.1-98.8%。这是BtMV在自然条件下侵染莴苣的首次报道。……   
[关键词]:芜菁花叶病毒;烟草脉带花叶病毒;甜菜花叶病毒;马铃薯Y病毒属;全基因组序列;重组;序列分析;分子变异
[文献类型]:硕士论文
[文献出处]:山东农业大学2008年