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北疆大蒜病毒病的调查和洋葱黄矮病毒的鉴定及序列分析

陈栋

   大蒜是新疆重要的蔬菜作物之一,在北疆大田生产中大蒜植株出现条纹花叶、矮化、畸形、坏死等明显的病毒病症状,严重影响大蒜了生产及其产量。2007年分别在新疆天山以北的乌鲁木齐、石河子、吉木萨尔、伊犁昭苏、兵团农四师76团等大蒜主要种植区,采集症状表现明显的样品。通过电子显微镜观察,可以观察到大小为780×11nm的病毒粒体。 依据已报道的大蒜常见病毒的核苷酸序列设计特异性引物,以带毒大蒜总RNA为模板,进行反转录PCR扩增,只有OYDV的特异性引物可扩增得到长1402bp左右的片段,将PCR产物连接到PMD18-T载体中再转化到大肠杆菌TOP10。通过菌落PCR鉴定,可得到大小为1402bp左右的片段,对5个阳性克隆进行序列测定,用DNAMAN软件分析,片段大小为1402bp,编码467个氨基酸;5个克隆可分为两组,并且两组间有较显著差异,两组间核苷酸同源性为81%,氨基酸同源性达85%;其中XJJM-3, XJJM-6为一组,组内核苷酸同源性达99%,氨基酸同源性达98%,与已报道的来自山东金乡的AJ409311高度同源,核苷酸同源性最高达99 %,氨酸序列同源性最高达99 %;XJJM-2, XJJM-4, XJJM-5克隆为一组,组内核苷酸同源性达99%,氨基酸同源性达99%,与已报道的来自日本的AB000481高度同源,核苷酸同源性达98%,氨酸序列同源性达98%。……   
[关键词]:北疆;大蒜;大蒜病毒;分子鉴定;检测
[文献类型]:硕士论文
[文献出处]:石河子大学2008年