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鹅脂肪性状候选基因的研究

曲湘勇

   本试验用PCR—SSCP方法对四川白鹅、溆浦鹅和洞庭草鹅研究了与脂肪性状可能相关的OBR和PPAR等基因,检测了基因的SNP,序列提交到GenBank。分析了品种内和品种间的基因、基因型分布、遗传多态性以及与其它动物的同源性。在对不同品种鹅进行脂肪性状测定基础上,分析了OBR基因和PPAR基因的SNPs基因型对鹅脂肪性状的影响及其遗传效应,筛选出优势基因型。采用δ差异显示法筛选出与鹅脂肪沉积性状显著相关的阳性EST,进行了克隆测序和同源性比对分析,找出了高度同源性的相关基因。所获阳性EST序列提交GenbBank数据库。结果表明: 1 OBR基因在溆浦鹅和四川白鹅的DNA片段中都存在3种不同基因型,该基因片段序列的56bp处有一个A→G的突变,该序列已登录GenBank(登录号为:DQ346681);该碱基突变导致氨基酸序列变异。本研究中的鹅OBR基因片段序列与火鸡和部分鸡的OBR基因序列同源性达100%,与人、猿、猪、马、犬等哺乳类单胃动物的同源性都达到96%。不同品种中OBR基因型频率和基因频率存在显著差异。 2 OBR基因的SNP基因型对本研究的鹅腹脂重、腹脂率和血浆VLDL浓度都有极显著或显著的影响,但在两品种间存在明显差异。BB型是降低鹅腹脂重、腹脂率和血浆VLDL浓度的优势基因型,其贡献率对溆浦鹅超过29%,对四川白鹅超过20%。AA型是提高溆浦鹅腹脂重、腹脂率和血液VLDL浓度的优势基因型,其贡献率超过8%。OBR基因对溆浦鹅腹脂重的主效应指数(MEI)达到44.466,对血浆VLDL浓度为21.284,对腹脂率为16.797;OBR基因对四川白鹅腹脂重的MEI达到9.638,对血浆VLDL浓度为21.112,对腹脂率为8.442,对皮脂厚为10.685。推测OBR基因可作为鹅脂肪性状的主效应基因。 3 PPARα基因在洞庭草鹅中存在单核苷酸突变,但氨基酸序列不变。该序列与番鸭、家鸭、鼠等动物有95%以上同源性。SNP基因型对该鹅腹脂重、腹脂率有显著影响,其中AA型和BB型腹脂重显著低于AB型,BB型腹脂率显著低于AB型。BB型是降低鹅腹脂重、腹脂率的优势基因型,其贡献率超过8%,而AB型对腹脂率产生5.263%的正向贡献率。PPARα基因对腹脂重的MEI为12.11,对腹脂率为17.31。推测PPARα基因可作为鹅脂肪性状的主效应基因或与控制腹脂性状的主基因连锁。 4采用δ差异显示法,发现在鹅的不同组织特异性表达的阳性11条片断,经克隆测序后均递交到GenBank,登录号为:EY199060~EY199070。经BLAST比对,发现肝脏组织的一条扩增差异片断与leptin(ob)基因有94%的同源性;一条腹脂组织扩增差异片断与P2RY5基因有95%的同源性。说明该两条差异片断与鹅脂肪沉积性状存在明显关系。……   
[关键词]:;脂肪性状;候选基因;SNPs;δ差异显示
[文献类型]:博士论文
[文献出处]:湖南农业大学2007年