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中国13个地方乌骨鸡品种遗传多样性研究

张晶鑫

   本研究分析了中国13个地方乌骨鸡品种在30个微卫星位点上的遗传多样性。计算了等位基因频率、有效等位基因数、杂合度、多态信息含量等指标。并利用两种遗传距离(DS、DA)和两种聚类方法(UPGMA、NJ)分别进行聚类分析。结果表明: 1共检测到248个等位基因。其中等位基因数最多的位点为ADL136、LEI0094:12个;最少的为MCW150:4个;平均等位基因数为8.2667,平均有效等位基因数为4.1403。 2 30个微卫星位点均表现为多态性,平均多态信息含量为0.6851,其中有17个标记的PIC值在0.7以上,除ADL201、MCW147、LEI0166位点为中度多态外,其余27个微卫星位点均为高度多态。 3各乌骨鸡群体的遗传多样性较为丰富,并具有较高的选择潜力。平均期望杂合度最高的是略阳鸡,为0.6954;最低的是旧院黑鸡,为0.6410。 4平均基因分化系数Fst为9.95%,表明9.95%的遗传变异源自品种间的差异,而另外90.05%则因个体的差异而产生。除MCW0330位点为杂合子缺失外,其它29个位点均为杂合子剩余,13个乌骨鸡品种在30个微卫星位点上的基因流为2.2628。 5两种遗传距离得出的结果完全一致,遗传距离最近的是金湖乌凤鸡与丝绒乌骨鸡,分别为0.1552(DS)和0.1459(DA);遗传距离最远的是金湖乌凤鸡与旧院黑鸡,分别为0.4419(DS)和0.4337(DA)。 6两种聚类方法得出的聚类结果基本一致,13个地方乌骨鸡品种均被聚为5个类群。金湖乌凤鸡、江山乌骨鸡、丝绒乌骨鸡、兴文乌骨鸡聚为一类;盐津乌骨鸡、沐川乌骨鸡、郧阳白羽乌鸡聚为一类;略阳鸡、丝毛乌骨鸡聚为一类;唯一的区别是余干乌骨鸡在UPGMA聚类中与旧院黑鸡聚为一类,而在NJ聚类中与竹乡鸡、乌蒙乌骨鸡聚为一类。……   
[关键词]:乌骨鸡;微卫星;遗传多样性;聚类分析
[文献类型]:硕士论文
[文献出处]:扬州大学2007年