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我国部分鹅品种(类群)Myostatin基因SNPs及遗传多样性研究

杨凤萍

   本研究首次获得家鹅Myostatin基因3′-调控区部分序列(GenBank登录号为DQ291134)以及内含子1全序列(GenBank登录号为DQ355160),分析了两序列结构特点,并利用GenBank中不同物种Myostatin基因相关的序列信息,初步研明了Myostatin基因cDNA、3′-调控区以及内含子等核苷酸序列对分析物种进化的贡献;在测序的基础上,利用Oligo 6.0和Primer Premier V5.0引物设计软件设计了15对PCR-SSCP引物,首次获得了3个品种鹅Myostatin基因不同区段单核苷酸多态(SNP)特点,初步分析了不同SNPs与扬州鹅(80日龄)、皖西白鹅(110日龄)和五龙鹅(110日龄)的屠体重、胸肌重、胸肌率、腿肌重、腿肌率、全净膛重、全净膛率等屠体性状之间的关系;利用多态性丰富的6个微卫星基因座对雁鹅、皖西白鹅、五龙鹅、扬州鹅、浙东白鹅、兴国灰鹅、四季鹅以及引进品种莱茵鹅等8个家鹅品种(类群)的遗传多样性以及亲缘关系进行了探索。研究结果如下: (1)家鹅Myostatin基因不同区域序列特征为: 5′-调控区核苷酸序列的碱基组成中,A+T的比例为63.32%,G+C为36.44%;转录起始点位于第1外显子上游117bp处;转录起始点上游﹣73bp处为CCAAT盒,﹣27bp处有一TATA盒;与GenBank中登录的鹅同一序列的同源性高达99%。同时比对结果发现,在﹣386bp处(T→A)、﹣371bp处(T→G)、﹣176bp处(A→T)、﹣154b处(A→T)、﹣72bp处(C→T)具有待检测的单碱基突变位点。……   
[关键词]:家鹅;Myostatin基因;序列;系统发育树;SNPs;微卫星;遗传多样性;亲缘关系
[文献类型]:博士论文
[文献出处]:扬州大学2006年