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中国三个地方家兔品种和三个配套系的微卫星DNA遗传多态性研究

马雪峰

  本研究利用10个微卫星标记,分析了福建黄兔、江西万载兔和四川白兔三个地方家兔品种及伊拉兔、伊普吕兔和布列塔尼亚兔三个配套系在分子水平上的遗传多样性,探讨了各群体内的遗传变异及群体间的遗传关系,为家兔遗传资源的合理利用和保护提供科学依据。研究中利用变性聚丙烯酰胺凝胶电泳检测微卫星的PCR产物,根据电泳结果统计分析出每一个体的基因型,经过计算获得了微卫星位点的等位基因频率、多态信息含量、群体杂合度以及群体间的遗传距离,并根据遗传距离对6个家兔群体进行了聚类分析。结果表明,所选用的10个微卫星位点都表现出了较高的多态性,每个微卫星标记平均检测到4.8个等位基因;多态信息含量在0.6429~0.7800之间,平均为0.6853;杂合度在0.4130~0.9941之间,平均为0.8555,表明这10个微卫星位点能够提供的遗传多样性信息量大,可以进一步选择利用。6个家兔群体的遗传杂合度均较高,在0.8133~0.9035之间,其中以布列塔尼亚兔的杂合度最高,表明不同家兔群体的遗传多样性比较丰富,具有很大的保种潜力。从计算所得的Nei氏标准遗传距离和Da遗传距离来看,6个家兔群体之间的遗传距离变异不大。根据两种遗传距离进行了邻近结合法(NJ法)和非加权组平均法(UPGMA法)聚类,从得到的4个聚类图中可以看出,6个家兔群体的聚类结果有大同小异之处。在UPGMA图中,两种遗传距离的聚类结果表明,布列塔尼亚兔、万载兔和四川白兔的遗传关系较近,伊拉兔、伊普吕兔和福建黄兔依次与其它群体的遗传关系较远:在两种遗传距离的NJ聚类图中,伊普吕兔和伊拉兔都与其它群体的遗传关系最远,各自形成一个分支,这与UPGMA聚类得出的结果基本一致。从4个聚类图中可以看出福建黄兔与其它家兔群体的聚类结果较为复杂,因此得出的结果有待于进一步研究证实。……   
[关键词]:家兔;微卫星标记;遗传多态性
[文献类型]:硕士论文
[文献出处]:中国农业科学院2006年