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三种马铃薯Y病毒属病毒的分子特性

田延平

  从河北、北京、山东泰安和潍坊等地的萝卜、大白菜、甘蓝、油菜上分离得到了8个芜菁花叶病毒(Turnip mosaic virus,TuMV)分离物,测定了它们3′末端cDNA片段的序列。根据衣壳蛋白基因(coat protein,CP)核苷酸序列可以将这8个分离物与本实验室得到的另外2个TuMV分离物分为3组:泰安旧镇大白菜(JZBC)、甘蓝(JZGL)和萝卜(JZLB)分离物为一组;北京萝卜(BJLB)、潍坊萝卜(WFLB)与引起萝卜红心病的TuMV分离物(WFLB99)为一组;泰安范镇、河北、潍坊(WFLB04)和泰安旧镇油菜(JZYC)的分离物为一组。与Genbank中其它分离物的衣壳蛋白基因核苷酸序列进行系统分析发现,本研究中的JZYC、FZLB、HBLB位于Basal-BR组,WFLB、BJLB位于Asian-BR组,JZLB、JZGL、JZBC位于World-B组。本研究首次发现中国有TuMV Basal-BR组分离物的存在。从山东、河南、安徽、云南、甘肃、黑龙江等省的主要烟区采集样品,利用RT-PCR技术克隆到了29个马铃薯Y病毒(Potato virus Y,PVY)分离物3′-末端部分基因组,测定了其核苷酸序列,同时测定了其中25个分离物HC-Pro基因的核苷酸序列。与Genbank中85个PVY分离物CP基因核苷酸序列分析发现,这些分离物可以分为O、N及C三个组,在N组中还包括一个小的亚组NTN;O组中包括N:O亚组。本研究中山东TX91、AQ1、MY60、F8,河南HN8,安徽A33等6个分离物位于N组中,其中TX91及AQ1位于NTN亚组;黑龙江H20、H18、H11,山东F4、MY55、MY59、Q23、ZC37、ZB3、ZB1、ZC39,安徽A26、A2、A5,河南HN6、HN10、HN43,甘肃G5、G14、G10、G1、G8、G15等23个分离物位于O组。根据69个HC-Pro基因的核苷酸序列分析表明可以分为两个组,山东MY55、F8,河南HN10,安徽A5、A33等位于一个组,山东AQ1、TX91、ZC37、ZC39、MY60、MY59、ZB1、ZB3,河南HN6、HN43、……   
[关键词]:马铃薯Y病毒;芜菁花叶病毒;烟草脉带花叶病毒;马铃薯Y病毒属;衣壳蛋白;UTR;克隆;序列分析
[文献类型]:硕士论文
[文献出处]:山东农业大学2006年