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皱纹盘鲍遗传图谱构建及生长相关性状的QTL定位

刘贤德

  利用AFLP、RAPD和微卫星标记,以皱纹盘鲍日本岩手一个野生雌性个体(J)和中国大连雄性个体(C)杂交F1为作图群体,构建皱纹盘鲍遗传图谱并对生长相关的9个性状进行了QTL分析。亲本和86个子代个体共产生8个微卫星位点,41个RAPD标记,2688个AFLP标记。在这些标记中,有383个(包括365个AFLP标记,10个RAPD标记,8个微卫星位点)是多态标记并在其中一个亲本产生分离:241个在母本中分离,146个在父本中分离(包括部分相同的微卫星位点)。经过顺序邦弗朗尼校正之后,在雌性标记中有232个,雄性标记中有134个符合孟德尔分离定律(p≥0.05)。利用雌雄性的分离标记分别构建了皱纹盘鲍的雌性和雄性连锁图谱。雌性图谱框架图有119个标记定位到22个连锁群上,覆盖基因组的长度为1773.6 cM,平均间隔为18.3 cM。雄性框架图谱有94个标记定位到19个连锁群上,覆盖基因组1365.9 cM ,平均间隔为18.2 cM。性别标记定位到雄性图谱但没有定位到雌性图谱上,推测皱纹盘鲍的性别决定机制可能XY型,其中雄性为异配性别。偏分离标记显示为纯合子过剩并成簇排列,说明这些标记可能与鲍鱼某些基因的不兼容性有关。利用该图谱进行了生长相关性状的QTL定位,在雌性图谱和雄性图谱上,共定位了28个关于壳长、壳宽、肌肉重等生长相关性状的QTL,单个QTL可解释的表型变异为8.0%~35.9%。9个性状的表型相关均达到极显著水平(p<0.001),Pearson相关系数均超过0.81。共检测到4个与壳长和壳宽相关的QTL,均定位到J3、J12、J19和C9连锁群上。与全湿重有关的2个QTL,定位到J1和C1上。与壳重相关的1个QTL定位到雌性第15连锁群上。共检测到4个关于软体部重的QTL,分别定位到J4、J5和C1、C7连锁群上。肌肉和头部重的QTL分别定位到J4和C1连锁群上,其中在J4连锁群上定位了两个QTL。4个关于性腺和消化腺的QTL,分别定位于雌性J1,J5、J10和C9连锁群上。有关外套膜重的4个QTL分别定位到J4、C1、C9和C12上,鳃重的QTL定位在J1和C9上。与生长相关的QTL在连锁图上存在成簇分布的特点,28个QTL主要集中在……   
[关键词]:遗传图谱;AFLP;RAPD;微卫星;QTL;皱纹盘鲍
[文献类型]:博士论文
[文献出处]:中国科学院研究生院(海洋研究所)2005年