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中国七个地方绵羊品种微卫星DNA的遗传多样性研究

杨燕

  根据项目任务要求,本研究利用微卫星标记技术,对我国的7个地方绵羊品种:湖羊、哈萨克羊、巴音布鲁克羊、阿勒泰羊、黑藏羊、白藏羊和晋中羊的遗传多样性进行研究,探讨了它们之间群体内、群体间的遗传变异。研究结果如下:1.在28个微卫星位点中,共检测到286个等位基因,平均每个位点为10.6个。其中以AGLA269位点检测到的等位基因数目最多,为18个;其次是BM4311位点,为15个等位基因。等位基因数目最少的位点为BM315、ILSTS021位点,分别检测到4个等位基因。2.运用软件对受试羊进行优势等位基因和稀有等位基因分析,结果表明:28个微卫星位点都有优势等位基因存在。有11个位点检测到稀有等位基因。3.以等位基因频率为基础,得出位点的平均杂合度在0.0629~0.5903之间,群体平均杂合度在0.3421~0.4215之间,属于中度杂合群体和中度杂合位点。根据统计结果除BM315、ILSTS021的PIC<0.5之外,其余26个位点均为高度多态位点。在26个高度多态位点中,0.60<PIC<0.70 的共有4个位点,占到15.38%,0.70<PIC<0.80的共有13个位点,占到50.00%,0.80<PIC<0.90的共有9个,占到34.62%。在26个高度多态位点中,以AGLA269位点的多态信息含量最高,达到0.8712;ILSTS021位点的多态信息含量最小,为0.3453。在7个品种中,湖羊的多态信息含量最高,为0.7590;哈萨克羊的最低,为0.7317。4.对受试羊进行有效等位基因分析表明:在湖羊检测到的有效等位基因数目最多,为5.5309。有19个位点的平均有效等位基因数目都超过4个。5.运用软件,进行哈代—温伯格平衡检验,我们得出几乎所有的位点在7个绵羊品种中都处于哈代—温伯格不平衡状态,只有个别位点在个别品种中达到平衡,如BMC1206 在晋中羊品种中,ILSTS021在哈萨克羊品种中基本达到平衡。6.中性测试结果表明:共有5个位点(MB009,BM1341,BM3033,BMS6444,BM315)属于中性位点。7.对受试羊进行基因流分析,发现巴音布鲁克羊和阿拉泰羊之间有较大的基因流(7.5731),基因流相对最小的是黑藏羊和湖羊之间,其值为3.0964。8. F-统计量分析表明:各标记FST的变化范围是从BMS875的0.0293到ILSTS021的0.3969,平均值为0.0747;群体每代迁移数在0.3799 (ILSTS021)和8.2854 (BMS875)之间变动,平均值为3.0964。9.运用共祖遗传距离,采用UPGMA法和NJ法对受试羊进行聚类分析可以看到:湖羊与哈萨克羊始终有较近的亲缘关系;巴音布鲁克羊与阿勒泰羊也存在较近的遗传关系。而黑藏羊、白藏羊与晋中羊的聚类情况比较复杂。……   
[关键词]:绵羊;微卫星;遗传多样性;遗传距离;聚类分析
[文献类型]:硕士论文
[文献出处]:西北农林科技大学2004年