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中国部分黄牛BoLA基因多态性与生产性能的相关分析

王兴平

  本实验以秦川牛、鲁西牛、南阳牛、晋南牛四个品种的163头牛为研究对象,采用PCR-RFLP和SSCP方法,结合克隆测序分别研究了MHC的DRB3基因第二外显子和DRA基因第二外显子的分子遗传变异,并运用最小二乘线性模型,对所发现多态位点与牛的生产性状进行了相关分析,结果如下:DRB3基因第二外显子在不同品种牛群体之间的优势基因型和优势等位基因不同,在位点上,从整个群体来看,优势基因型为AB和BC;秦川牛、南阳牛、鲁西牛群体中B、C为优势基因,晋南牛群体中A为优势基因。在MspⅠ-RFLP位点上,秦川牛、南阳牛和晋南牛群体中的优势基因型为AB,鲁西牛群体中的优势基因型为BB。四个群体中,A、B等位基因所占的比例接近1:1,但是基因B略占优势。在RFLP-TaqI位点上四个品种都不存在多态。经过χ2适合性检验,在DRB3基因第二外显子的研究中,HaeIII酶切位点上,南阳牛未达到Hardy-Weinberg平衡状态;MspI酶切位点上,鲁西牛未达到Hardy-Weinberg平衡状态。DRA基因第二外显子的SSCP分析中,秦川牛和晋南牛群体的优势基因型为AF,优势基因为A;鲁西牛中的优势基因型为BC,优势基因为B;南阳牛群体中优势基因型为BF,优势基因为B。经过χ2适合性检验,秦川牛、晋南牛和南阳牛在DRA基因第二外显子的SSCP分析中,基因频率和基因型频率均未达到Hardy-Weinberg平衡状态。秦川牛、鲁西牛、南阳牛和晋南牛四个群体中,在DRB3-HaeIII位点和DRA基因SSCP位点上,四个品种牛群的多态信息含量都达到高度多态(PIC>0.50),在DRB3-MspI位点上,四个品种牛群的都达到中度多态(0.25<PIC<0.5),说明这两个基因座位在四个群体中的多态性高,遗传变异大。本实验检测到了DRB3基因第二外显子的第18、19、24、26、64、65、75、76、96、97、127、135、146、154、155,157、165、167、188、196、199、207、208、209、217、219、220、241、242、245、246位发生了突变,其中154、155,157、165、167位的突变使得该位点产生多态,可见,DRB3基因的第二外显子具有高度多态性。通过DRA基因第二外显子的SSCP分析和克隆测序,检测到第116位有一个G→A的点突变;第197位有一个T→C的点突变,由此可见,DRA基因为相对保守,多态性不高。在对四种中国地方黄牛基因多态性与生产性状相关性研究方面,鲁西牛和秦川牛的体重、体尺年龄效应明显,标记效应不显著,而南阳牛在6、12月龄时DRB3基因exon2的标记效应均不显著,18月龄时体长HaeⅢ-RFLP标记效应显著;在体高方面,2岁南阳牛的DRA基因exon2的SSCP标记效应显著,3岁南阳牛的DRA-SSCP和DRB3-MspⅠ-RFLP标记效应显著。在DRB3基因exon2的HaeⅢ-RFLP位点,AC基因型对体尺有显著效应,在MspⅠ-RFLP标记和DRA 基因exon2的SSCP标记,其所有基因型对体重、体尺指标影响不大。……   
[关键词]:;生产性能;分子标记;BoLA;PCR-RFLP;SSCP
[文献类型]:硕士论文
[文献出处]:西北农林科技大学2004年