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丝羽乌骨鸡微卫星位点多态性及其与蛋品质性状的相关分析

孟祥军

  本研究以丝羽乌骨鸡BM、BF两个蛋用新品系为试验材料,应用多重PCR结合全自动电泳技术及SAS程序,分析选自家禽基因组中的18个微卫星标记与蛋重、蛋形指数、蛋壳强度等9个蛋品质性状的相关。找出与性状相关显著的标记,并进行了同一标记不同基因型间的多重比较;同时,本研究还进行了多重PCR反应体系及组合的优化。结果如下:(1)通过多重PCR反应体系及组合的优化,将18个微卫星标记分成5个引物组合对DNA模板进行扩增,然后将扩增产物分成3组,用ABI 3100-Avant遗传分析仪检测,能清楚检测出结果,表明本次多重PCR组合试验是成功的。(2)所选用的18个微卫星标记表现出丰富的多态性。18个标记平均检测到的等位基因数为7.444(3~15),平均观测杂合度为0.3962(0.030~0.775),平均期望杂合度为0.7301(0.404~0.842),平均多态信息含量为0.669(0.382~0.912)。(3)通过对标记与蛋品质性状的方差分析,总共发现8个标记基因座(MCW0294、MCW0289E、MCW0258、MCW0068、MCW0168、MCW0254、MCW0036、MCW0200)与8个蛋品质性状(蛋形指数、蛋壳强度、蛋壳厚度、蛋黄比色、蛋黄比例、蛋壳比例、蛋白比例、哈氏单位)之间存在显著或极显著的相关。对与性状相关显著的标记进行不同基因型间的多重比较,发现①标记MCW0289E中,Ⅱ基因型的蛋壳强度、蛋壳比例均值最高,与其它基因型差异显著(除蛋壳比例中的FH基因型);标记MCW0258中,AG基因型的蛋壳强度、蛋壳比例均值最高,与其它基因型差异显著(除蛋壳强度中的FF基因型);标记MCW0068中,CC基因型的蛋壳强度、蛋壳比例均值最高,与其它基因型差异显著。该三种基因型有望作为蛋壳强度、蛋壳比例的早期辅助选择标记。②标已MCW0289E中,HH基因型的蛋黄比例均值最低、哈氏单位均值最高,分别与其它基因型差异显著;标记MCW0258中,JO基因型的蛋黄比例均值最高、哈氏单位均值最低,分别与其它基因型差异显著。该两种基因型有望作为蛋黄比例、哈氏单位高低的早期辅助选择标记。③标记MCW0289E中,BG基因型的蛋形指数均值最高、哈氏单位均值最低,分别与其它基因型差异显著;标记MCW0258四川农业大学硕士学位论文丝羽乌骨鸡微卫星位点多态性及其与蛋品质性状的相关分析中,JL基因型的蛋形指数均值最低、哈氏单位均值最高,分别与其它基因型差异显著。该两种基因型有望作为蛋形指数、哈氏单位高低的早期辅助选择标记。在多重比较过程中,发现了几个与蛋品质性状显著相关的等位基因:①标记MCWO258中,AG基因型的蛋壳强度均值最高,HO基因型的蛋壳强度均值最低,二者差异显著;BG基因型的蛋壳强度均值较高,JO基因型的蛋壳强度均值较低,二者差异显著。说明G、0可能是与蛋壳强度存在显著正、负相关的一对等位基因。②标记MCW0258中,JL基因型的蛋形指数均值最低,JJ、LL、FL基因型的蛋形指数均值也较低,并与其它基因型差异显著,说明等位基因J、L可能与蛋形指数存在显著负相关。③标记MCW0068中,CC基因型的蛋壳强度均值最高,与其它基因型差异显著;而CI基因型的蛋壳强度均值最低,BI基因型的蛋壳强度均值也较低,并与其它基因型差异显著。说明等位基因I可能与蛋壳强度存在显著负相关。(4)本研究还进行了丝羽乌骨鸡蛋品质各个性状间的相关分析,结果发现蛋壳强度与蛋壳厚度极显著正相关(P<0.01);蛋黄比例与蛋重极显著负相关(P<0.01):蛋壳比例与蛋壳强度、蛋壳厚度极显著正相关(P<0.01);蛋白比例与蛋重极显著正相关(P<0.01),与蛋黄比例、蛋壳比例极显著负相关(P<0.01);哈氏单位与蛋黄比例极显著负相关(P<0.01),与蛋白比例显著正相关(P<0 . 05)。……   
[关键词]:丝羽乌骨鸡;蛋品质;微卫星荧光标记;多重PCR;相关分析
[文献类型]:硕士论文
[文献出处]:四川农业大学2004年