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奶牛和肉牛STR基因座遗传多态性及亲权鉴定方法研究

贾名威

  随着分子生物学的发展,遗传标记的概念发展为在核酸分子水平上具有相对差异的等位区域。STR基因座遵循孟德尔遗传规律,在基因组中分布广泛,具有PCR扩增,电泳分型等优点,在生物学各领域中得到广泛应用。在亲权鉴定、个体识别应用中,由于STR系统的使用,使检测进入了一个新的阶段,检测水平有了空前的提高。本研究的目的在于:①分析奶牛和肉牛6个STR基因座遗传多态性;⑦用微卫星标记技术建立准确快捷的亲权鉴定方法。1 奶牛和肉牛6个STR基因座遗传多态性研究试验所用样本采自两个品种,共161个样本。其中9份中国荷斯坦奶牛种公牛精液样本,23个家系中49份中国荷斯坦奶牛(母)血液样本;103份西门塔尔等肉牛品种种公牛精液样本。分别提取DNA,应用6对微卫星引物对奶牛和肉牛进行遗传多态性研究。利用PCR技术和复合电泳银染技术检测奶牛和肉牛BM2113、BM1862、BMc701、BM2934、TGLA122、BM720等6个STR基因座的多态性分布,并计算该6个基因座的基因频率(Pi)、个体鉴别力(DP)、杂合度(H)、多态信息含量(PIC)、和非父排除概率(PE)。结果显示:6个STR基因座的基因型分布符合Hardy-Weinberg平衡,奶牛中6个STR基因座中BM2113基因座的DP、H和PIC最高,TGLA122基因座的PE最高。6个STR基因座的累积个体鉴别力(C_(DP)为0.99997,累积非父排除能力(C_(PE))为0.98827。肉牛中6个STR基因座中BM1862基因座的DP、H、PIC、PE都是最高,6个STR基因座的累积个体鉴别力(C_(DP))为0.99999,累积非父排除能力(C_(PE))为0.99578。6个STR基因座具有高度遗传多态性,可用于牛的遗传连锁分析、个体识别和亲权鉴定等研究领域。2 应用微卫星分子标记对奶牛和肉牛进行亲权鉴定运用PCR技术对BM2113、BM1862、BMc701、BM2934、TGLA122、BM720共6个STR基因座进行扩增,扩增产物分两组混合后经聚丙烯酰胺凝胶电泳和银染检测,扩增片段互不干扰。通过分析确定母女关系的2头奶牛血液样本和5个嫌疑父亲的精液样本的DNA,一头母本已知的奶牛在嫌疑父本中找出父亲,并计算父权概率,这6个STR基因座用于亲权鉴定获得99.993%的父权概率。证明用银染法检测STR基因座扩增产物可用于奶牛亲权鉴定。……   
[关键词]:STR基因座;遗传多态性;;亲权鉴定
[文献类型]:硕士论文
[文献出处]:南京农业大学2003年