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八个不同蛋鸡群体的RAPD标记研究

王秋丽

  本研究利用随机扩增多态性DNA技术对褐壳蛋鸡(HK)、白壳蛋鸡(BK)、粉壳蛋鸡(FK)、绿壳蛋鸡(LK)和海兰鸡种C系一代(HC-1)、C系二代(HC-2)、海兰鸡种A系一代(HA-1)、A系二代(HA-2)8个蛋鸡群体在DNA水平上进行了遗传多态性分析,寻找出不同蛋鸡群体的特异性分子标记,并探讨了群体间的遗传距离以及八个群体之间的亲缘关系。结果如下:一、八个不同蛋鸡群体的特异性分子标记研究(1)在优化PCR反应条件的基础上,建立了比较完善的RAPD技术体系。在50条随机引物中,30个引物未出现任何扩增产物,12个引物表现为单态,筛选出8个多态引物,每个多态引物的扩增条带数在2~10条之间,平均为5.3条。(2)通过利用8个引物对八个不同的蛋鸡群体进行PCR扩增,发现在OPV_(15)位点上,共扩增出10条DNA片段,其中A条带可以作为区别HK与BK的分子标记,而E条带可作为HA-1与HA-2的特异性条带。在OPB_(08)位点上,共扩增出12条DNA片段,F条带可以作为HA-1与HA-2的特异性条带,在OPH_(05)位点上,共扩增出12条DNA条带,I条带可以作为区别BK与LK的条带,在OPH_(20)位点上,共扩增出11条DNA片段,C条带可以作为区别LK与FK、BK的特异性条带,但无法区别BK与FK,在OPH_(19)位点上,共扩增出14条DNA片段,C片段可以作为HC-1与HC-2的特异性条带。在OPH_(13)位点,共扩增出10条DNA条带,H片段可以作为HC-1与HC-2的特异性条带。二、八个不同蛋鸡群体的遗传多样性分析(1)HK群体内条带相似率最小(0.824);HA-2群体内的条带相似率最大(0.897)。说明HK群体中遗传纯度不高,具有较大的遗传变异范围;而HA-2群体则具有较大的群体一致度。(2)HA-1群体中一条带的平均等位基因频率最大(0.7019),BK群体中条带的平均等位基因频率最小(0.4844)。群体内的杂合度可以反映群体内遗传多样性,表明群体内的遗传变异范围。HK群体的杂合度最大(0.5889),表明HK群体中遗传多样性高,具有较大的遗传变异范围;而BK群体中的杂合度最小(0.3766),表明这个群体的遗传多态性较低,群内一致性较高。(3)在八个不同蛋鸡群体中,HK的遗传多样性指数最大(1.1598)。说明HK群体具有比其它群体较高的遗传多样性,可作为蛋鸡遗传改良的素材,而遗传多样性指数最小的是BK群体(0.6097),这可能与群体采用同质选配和近亲选配等育种手段有关。(4)本研究采用SPSS软件进行统计分析,根据Nearest Neighbor下的7种聚类方法进行聚类,其中欧氏距离、欧氏平方距离、夹角余弦、皮尔逊相关四种方法得出的结果是基本一致的,较能反映实际来源情况。而车贝雪夫距离、街区距离、明考夫斯基三种聚类方法与实际的群体来源分布有较大差异。各种聚类方法得出的结果有一定的差异,这是由不同处理方法各自的特性决定的,也可能与遗传标记以及所研究的位点等因素有关。(5)从聚类结果可以看出:在8个不同的蛋鸡群体中,FK与LK关系最近,这与群体的实际来源相符。HC一2与HA一2以及HC一1与HA一1亲缘关系最近,这与实际来源稍有出入,但是HC与HA是海兰褐壳鸡的不同品系,具有较高的同源性。而BK、HK、FK、LK与HC一1、HC一2、HA一1、队一2都表现出较远的遗传距离,说明引进品种和地方品种具有较远的亲缘关系。……   
[关键词]:分子标记;遗传多样性;杂合度;遗传距离;蛋鸡
[文献类型]:硕士论文
[文献出处]:西北农林科技大学2003年