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我国七个绵羊群体微卫星DNA的遗传多样性研究

吕慎金

  本研究利用微卫星标记技术,对我国西部七个地方绵羊群体:甘肃省的乔科羊(Qiao Ke Sheep QKS)、甘加羊(Gan Jia Sheep GJS)、欧拉羊(Ou la Sheep OLS)、岷县黑裘皮羊(Minxian Black Fur Sheep MBFS)、兰州大尾羊(Lanzhou Large Tailed Sheep LLTS);陕西的汉中绵羊(Han Zhong Sheep HZS)、同羊(Tong Sheep TS)以及一个外来品种无角道赛特(Poll Dorset Sheep PDS)作为对照,从分子水平进行了群体遗传学分析,探讨了它们之间的亲缘关系、群体间、群体内的遗传变异。并根据实验结果,结合各地绵羊品种的群体情况,提出了优势等位基因和稀有等位基因的存在及保护措施。研究结果如下:1.本研究筛选出30个微卫星位点,其中MB067只得到部分扩增结果,在BL6位点没有得到扩增结果。除BL6、BMS1678、ILST021这三个位点PIC<0.50外,0.50<PIC<0.60的有7个,占到25.93%,0.60<PIC<0.70的共有15个位点,占到55.56%,0.70<PIC<0.80的共有5个位点,占到18.52%,在27个高度多态位点中,以MB6526位点的多态信息含量最高,达到0.7824,ILST021位点的多态信息含量最小,为0.3883。2.利用GENEPOP、GDA、DISPAN程序计算了30个微卫星位点的等位基因频率,并以等位基因频率为基础,得出各位点的(杂合度)基因多样度、有效等位基因数。结果表明:群体杂合度在0.56~0.91之间,亚群体杂合度在0.47~0.80,群体间的遗传分化系数0.06~0.24之间,总群平均杂合度为0.7943,亚群平均杂合度为0.6790,总群体平均遗传分化系数为0.14。有效等位基因数目从1~8个不等,30个位点,七个群体中,以乔科羊和汉中绵羊检测到的有效等位基因数目最多,平均达到3.4个,就位点而言,BM6526、BMC1206、BM3033、BMS1678、BMS1724这几个位点检测到的有效等位基因数最多,平均都达到四个以上。可以认为这几个位点是最优势位点。3.利用GDA、DISPAN程序得出了共祖遗传距离(D_(coa))、Nei氏标准遗传距离(D_s,1972)。并分别进行了NJ和UPGMA聚类。汉中绵羊和同羊聚为一类,藏羊系的甘加型、欧拉型、乔科型聚类情况比较复杂,同是甘肃的兰州大尾寒羊和崛县黑裘皮羊的聚类情况也比较特殊,其中原因还有待于进一步研究论证。4.运用GDA等软件,对实验结果进行优势等位基因和稀有等位基因分析,结果表明:7个群体24个微卫星位点中的优势等位基因的数目较多。在URBO37位点,有四个群体(大尾寒羊、欧拉羊、乔科羊、同羊)的优势等位基因集中在1 94bP这一片段。对稀有等位基因的分析得出:在30个微卫星位点中,共有19个位点检测到稀有等位基……   
[关键词]:绵羊;微卫星;遗传多样性;遗传距离;聚类分析
[文献类型]:硕士论文
[文献出处]:西北农林科技大学2003年