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山东地方山羊遗传多样性研究

孙允东

  本文采用微卫星标记技术,选用27个位点,对山东四个地方山羊品种(济宁青山羊,崂山奶山羊,鲁北白山羊,莱芜黑山羊)进行了遗传多样性评价,通过计算遗传杂合度,多态信息含量,哈代温伯平衡的卡方值,不同品种的优势等位基因和特异等位基因频率,遗传分化系数,近交系数,同源基因个数,群体间的基因流动,微卫星位点的中性突变和群体内的杂合度,四个山羊品种的奈氏遗传距离和奈氏标准遗传距离,对四个山羊品种的群体结构进行了分析,并且对与生长性状相关的16个微卫星位点进行了相关性分析,找到了与生长性状紧密相关的微卫星位点。具体结果如下:1 四个山羊品种的遗传分化系数(Gst)较高平均达到0.302927,说明0.697073的遗传变异发生在群体内,但是群体间的变异也较高。平均F_(ST)为0.230385,说明0.769615的总遗传变异是由于群体内的遗传分化。近交系数(Fis)最小的为济宁青山羊(0.216115),说明四个山羊品种种内近交严重。2 崂山奶山羊,莱芜黑山羊,济宁青山羊,鲁北白山羊四个山羊群体的杂合度分别为:0..302366、0.493576、0.539375、0.582329。3 找到了不同群体的优势等位基因和特有等位基因。优势等位基因体现了群体特征,稀有等位基因具有较大的经济价值。4 找到了不同群体间的同源基因,并且分析了不同群体的基因流动情况,Nm值的变化从崂山奶山羊与济宁青山羊两个群体的0.4492到济宁青山羊与鲁北白山羊两个群体的1.4284。5 利用DISPAN计算的四个品种的遗传距离为:济宁青山羊与鲁北白山羊为一类,其次为莱芜黑山羊,距离最远的是崂山奶山羊。这个结果与不同群体间的基因流动值和同源基因个数相符合。6 四个山羊品种不同位点的多态信息含量(PIC)普遍较高,大部分大于0.5,表明选用的位点能较好的体现四个山羊品种的遗传多样性。7 四个山羊品种的群体结构检测表明,本试验所选用的27个微卫星位点大部分处于哈代温伯不平衡状态,这可能与群体的数量和采样有关。8 用SAS6.12软件对与生产性状相关的16位点进行了方差分析,分析得出与生长发育性状相关的六个微卫星位点,分别为:BMS1724,BMS1943,BMS1290,BM6404,BM1818,MAF70。并且找到了每个位点对具体性状有正负效应的等位基因。……   
[关键词]:微卫星DNA标记;山东地方山羊;遗传多样性;生长发育;性状
[文献类型]:硕士论文
[文献出处]:山东农业大学2003年