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我国一些Potyvirus属和Carlavirus属成员的鉴定和分子变异研究

赵明富

  用马铃薯Y病毒科(family Potyviruidae)特异性简并引物(Sprimer,M4)和香石竹潜隐病毒属(genus Carlavirus)简并引物[Pcarl(+),M4]对12科40个植物样品进行RT-PCR扩增来检测植物病毒,结合序列分析,鉴定了了13种植物病毒共23个分离物,其中一些样品中存在两种病毒的复合侵染。测定了杭州地区侵染葫芦科作物的冬瓜(WG-BS)、西瓜(WM-BS)、丝瓜(SG-BS)、黄瓜(CU-BS)4个小西葫芦黄花叶病毒(Zucchini yellow mosaic virus,ZYMV)分离物的全序列(9592-9593个核苷酸)和南瓜日本品种(S-JP)、下沙南瓜(S-XS)、中国南瓜(P)和香瓜(MM-BS)等4个分离物3′-末端部分序列(1683-1684个核苷酸),外壳蛋白基因(CP)进化树分析表明存在一个全部由中国分离物(S-JP、WM-BS、MM-BS和S-XS)构成,彼此间高度相似的类群(第Ⅲ类群),该类群与其他分离物外壳蛋白基因核苷酸和氨基酸同源性分别为81.9%-87.3%和86.5%-92.8%,这是我国ZYMV分离物基因组全序列和特异群体的首次报道。用引物Sprimer在表现花叶症状的半夏(Pinellia)上检测到1个Potyvirus属病毒,测定了其RNA基因组3′-末端1733个核苷酸,同源性比较和进化树分析表明该病毒与大豆花叶病毒(Soybean mosaic virus,SMV)有较近的亲缘关系。该病毒和SMV在粒子大小、形态以及在寄主细胞引起的病变方面相似,和SMV抗血清有强烈反应,经摩擦接种可以侵染大豆的一些品种。所有这些表明该病毒为SMV的一株系,这是SMV能侵染天南星科植物首次报道。用特异性科属简并引物检测患病百合的线状植物病毒,在引进的欧洲百合品种Sorbonne(HZ2)中存在百合无症病毒(Lily symptomless virus,LSV)和百合斑驳病毒(Lily mottle virus,LMoV)的复合侵染,杭州麝香百合(L.Longirlorum)和引进的欧洲百合品种Siberia(HZ4)中仅含有LSV。测定LMoV-HZ2 RNA基因组的3′-末端1660个核苷酸序列,经外壳蛋白序列同源性和进化树分析,LMoV-HZ2分离物与LMoV杭州龙牙百合分离物(LMoV-HZ)分属于两个差异明显的群体。测定3个LSV杭州分离物基因组3′-末端1796个核苷酸序列,经外壳蛋白同源性和进化树分析,3个LSV杭州分离物高度相似,除韩国分离物(AJ13812)和日本分离物(D43801)外,其它分离物外壳蛋白核苷酸和氨基酸同源性高达98.2-99.3%,它们可能有着共同的起源。在英国喇叭水仙中检测到2种Potyvirus属病毒,其中一个为水仙迟季黄化病毒(Narcissus late season yellows virus,NLSYV),与中国水仙中的Potyvirus漳州浙 汀 人,} MI 学 位 论 义讣免物(l。Y-ZZ)进 7]’比较,两者丫(3’-木端1668个核甘酸同源性为72。l%,外壳蛋向庆冈核仟酸和氨基酸同源性分别为75.5%和兀.8%,3’-*TR核什酸同源例-为65.4%。3’-木端核分酸和外壳蛋白基因氨基酸进化树卜都形成 进化貌,具有较近的亲缘关系,但两者是否属于同一病毒有待于进一步研究。另一个为虎IIN)if青花口-病毒(OI‘nilhogal。In。n,osaic virus,OrMV),与己报道的 OrMV懊人不亚分离物(AF203528)外壳蛋白基因核昔酸和氨基酸同源性分别为98.5%和%.4%,这是该病奇侵染水仙属棺物首次报道。在杭州水仙中,用*。r切;心。;;s属简讣引物* *r-且(+广 僧到预期大刁的片段,获得的基因组3’-末端1852个核了酸序列,乓 fJ(’11人11,if·11。属成员幕 B旧13’-端的典型结构,与‘非5薯M病川(I。VM)、‘V令#S gi)j浙(I’VS)JllFi合儿爪病清(LSV)等厂OI·111,i)、11,M)戊U的外,;tn”俸冈核什酸和氨基酸同源性部低于刃%,与己经报道的两个中闷水仙v”陶(八、门1门巧,川川】厂6)八促川似,氮拈酸同源性分汕为Q00/o和们〕%。外。;’};’M化的小分析表山1它《0’】为同一病清,暂时命名为水fD 门引m蚓D汕对(八二11·Il‘。。。I,,IOI,11)I()。17111,111,11·11。,NC卜V)。测定了菜57普通花 卜病毒(BSS)?C000。O)。,1100OJCI《)uS,BCMV)菜只5离物(BC’MV上)基 l人H13’-末端1663个核#酸序列和花生分离物(BCMV十));t冈纠y-木端门叩个核什酸序列。两者在y.末端的1663个核昔酸同源忖为88”/o,BCMV个为 PStV分离物,在外壳蛋白基因核昔酸进化树叶f PStV分离物地川!分八滓异界著,中冈分离物与美国分离物位丁同一进化簇,高度川似卜闪占hJ能何共同的起源。SCMV七 与各分离物外壳蛋白基因核什酸I。u j16川-为洲_2O-9(人4o,氨某酸 l司源卜为88.5%-95.1o。在外壳蛋广基因核刊’网进化例小仆士子个条纹* 系(厂引V)素门分离物门儿卜SIV 分离物之问,。可能**芽 一’。测定了菜}Z黄了”IH病责(B))l了),)厂OI。,。,I以了仍c飞,j)的IJ,BYMV)杭J 菜-E叉5风时(B*M*-!IZ)基!月织3’-末端1629个核昔酸序列,包括N比基因部分序列、t叼Pj川人卜!3’一UIR *揪坝u NIb/CP裂角位点双氨基酸序歹为 Q/S冒/”厂’生 个多 厂串为3].0**。的外壳蛋一,蚜传相关基序?……   
[关键词]:简并引物;马铃薯Y病毒属;香石竹潜隐病毒属;序列分析;同源性
[文献类型]:博士论文
[文献出处]:浙江大学2003年