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中国栽培大豆遗传多样性SSR研究

王彪

  我国拥有极其丰富的大豆资源,明确我国大豆资源的遗传变异分布规律对大豆资源的管理与利用具有重要价值。传统的方法是根据农艺性状来分析其遗传变异,但农艺性状受自然环境和人为因素影响明显。随着大豆育成品种的增加,有限的表型变异己难以详细阐明2万余份大豆资源的遗传变异情况,需要从DNA分子水平深入研究我国大豆资源遗传变异分布规律。从中国农业科学院品种资源研究所大豆室构建的大豆预选核心种质中随机抽样,考察了18个性状,在质量性状保留比例为100%和数量性状的方差不显著的前提下,确定190份材料为大豆预选核心种质的一个无偏样本。用60对SSR引物对这些材料进行扩增,获得606个等位变异,平均每个位点有10个等位变异,位点多态信息量范围从0.55到0.99,平均为0.83。通过对相似系数矩阵的标准误分析,聚类分析,主成分分析,共表型矩阵之间的相关性测验,以及对核心种质取样比例和取样方法的研究,得出如下结论:1.首次研究了SSR引物种类和数量对分析栽培大豆品种之间遗传变异关系的影响。同一引物在不同的群体中遗传多样性水平和等位变异数表现不一样。等位变异数达到一定的范围时,才能真实地反映出品种之间的遗传变异关系。当群体的遗传变异范围变得相对较小时,分析个体之间的遗传变异关系所需的等位变异数目也相应降低。结合SSR位点在大豆基因组中的分布和基因多样性水平,能够找到分析栽培大豆遗传多样性的核心SSR引物。只有获得等位变异数在570以上,才能客观地反映出中国栽培大豆遗传变异关系。2.证实基于SSR数据反映出的遗传变异关系与基于农艺性状反映出的遗传变异关系不尽一致,把两者结合起来考察大豆品种之间遗传变异关系会得到更多的遗传信息。3.中国栽培大豆遗传多样性分布区域与我国地理区域有密切联系,地理分化明显,同一栽培区内材料之间遗传变异丰富,导致遗传分歧与地理来源不尽一致。中国栽培大豆存在三大遗传多样性高的群体,第一个遗传多样性高的群体是由北方春大豆,东北春大豆和黄淮夏大豆构成,第二个是由南方春大豆和南方夏大豆构成的遗传多样性高的群体,南方秋大豆是另一个遗传变异高的群体。栽培大豆在中国可能有多个起源中心。4.按500、400、300、200、100比例,分层按比例取样,卜较在不同取样比例下等位变异和遗传多样性指数符合度,当取样比例降到10%时,等位变异的保留比例为刀.26%。分层按比例取样等位变异和遗传多样性指数符合度比随机抽样要高,与聚类按比例取样相近。证实分层按比例取样是构建大豆核心种质的一种优先选择。……   
[关键词]:栽培大豆;遗传多样性;基因多样性水平;SSR
[文献类型]:硕士论文
[文献出处]:西北农林科技大学2002年