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用复杂近交家系定位家猪1号染色体背膘厚QTL的研究

蒋隽

  本次试验以丹麦Pig Research Station for Sows and Piglets培育的1个复杂近交家猪家系0—6世代中的192头家猪个体为试验材料,从定位于家猪1号染色体上的微卫星标记中通过预备PCR实验选用13个标记,进行正式的微卫星分析。扩增产物检测分别采用银染和测序仪变性PAGE方法分析微卫星扩增产物的分子量大小和标记基因型,用其中7个数据完整的多态性微卫星标记进行背膘厚(BFT)QTL分析。用多标记分析和区间定位二种方法进行QTL分析。结果如下:1 用“TOUCHDOWN”扩增微卫星标记,产量高,特异性好。银染检测法灵敏度较高,可检测到微量的扩增产物并确定各样品的基因型。但是,用银染结果估计扩增片断分子量的误差较大。用测序仪的变性PAGE方法,在每个泳道都设有内部分子量标准(size standards),因此,对于标记基因型和分子量判断的准确性高,结果应用于QTL定位研究比较可靠。2 采用CRI-MAP V2.4软件进行连锁分析得到一个包含7个微卫星标记,长度为103.1cM的遗传连锁图谱(括号内为Kosambi距离,单位为cM)如下:SW552(0.0)---S0316(25.9)---SW2035(52.8)---S0113(71.4)---SW974(87.3)---S0056(115.7)---SW1301(130.1)该标记图谱作为定位1号染色体上QTL的框架标记遗传图谱。3 多标记分析和区间定位均发现该家系猪1号染色体上存在显著的背膘厚QTL(p<0.01)。方差分析表明,与QTL连锁的标记(区间)的F值均超过5%显著阈值水准(p<0.05)。多标记分析将该QTL定位于微卫星标记S0113附近;区间定位估计将该QTL位于标记S0113~SW974之间,连锁位置估计为72.0cM。两种分析确定的QTL连锁座位是相吻合的。蒋隽:用复杂即将家系定位家猪1号染色体背膘厚QTL的研究4 采用多标记分析估计该背膘厚QTL 的加性效应和显性效应分别为1.6965m。土0.4092和2.1685mm士0.4851;区间定位估计该QTL的加性效应和显性效应分别为 1.7036mm士0.3393和 2.413m。士0.4555,均达到极显著水准。该QTL的显性效应大于加性效应(P>0.05),推测为完全显性或超显性遗传。5 本研究发现的QTL在连锁位置和基因效应与该区域物理定位的极低密度脂 蛋白受体基因 (VLDLR)相吻合,表明VLDLR可能是该QTL的候选基因。……   
[关键词]:家猪;QTL定位;背膘厚;微卫星;遗传效应
[文献类型]:硕士论文
[文献出处]:湖南农业大学2001年