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应用微卫星标记分析我国西南地区12个地方特色鸡群体的遗传多样性

杜宏

  本研究分析了我国西南地区12个地方特色鸡群体在20个微卫星座位上的遗传多样性;统计了等位基因频率、观察等位基因频率(Na)、有效等位基因数(Ne)、期望杂合度(He)、观察杂合度(Ho)、多态信息含量(PIC)和特有等位基因数(NPA)等遗传多样性参数;依据Nei氏DA和D_S遗传距离,采用NJ法和UPGMA构法建了系统聚类树;并用FSTAT软件计算了群体的遗传变异。结果表明: 20个微卫星座位均表现高度多态,在368个个体中共检测到226个等位基因,其中检测到等位基因数最多的座位是LEI0234座位(24个);最少的是MCW0037座位(6个);20个微卫星座上的平均观察等位基因为7.879,平均有效等位基因为4.021,多态信息含量介于0.501-0.82,期望杂合度0.563-0.849。所有座位均有群体偏离Hardy-Weinberg平衡(P<0.05),MCW0014座位在12个群体中均显著或极显著偏离Hardy-Weinberg平衡(P<0.05),MCW0111座位、MCW0067座位在11个群体中均显著或极显著偏离Hardy-Weinberg平衡(P<0.05),LEI0166座位仅在3个群体中均显著或极显著偏离Hardy-Weinberg平衡(P<0.05)。 12个群体的遗传多样性较丰富,平均多态信息含量为0.668,其中最高的是察隅藏鸡群体,为0.753,最低的是大宁河鸡,为0.582。平均期望杂合度为0.701,最高的是屏边乌骨鸡,为0.759,最低的是藏鸡,为0.612。群体遗传变异结果显示所选12个群体有88.3%的遗传变异来自群体内,11.7%来自品种间。 12个群体间的Nei氏DA和Ds的变化与其所处地域趋势基本一致,遗传距离最远的是察隅藏鸡与大宁河鸡(DA=0.4624,Ds=0.9813),最近的是贡山土鸡与武定鸡(DA =0.1358,Ds=0.1126)。系统聚类结果显示:云南的群体分为两支,一支为位于云南南部的支系,包括屏边乌骨鸡,勐海矮脚鸡和勐腊茶花鸡;另一只为位于云南北部的支系,包括贡山土鸡和武定鸡,采自西藏地区的两个群体包括藏鸡和察隅藏鸡位于云南南部支系和云南北部支系间。……   
[关键词]:;特色品种;微卫星;遗传多样性;云南;西藏
[文献类型]:硕士论文
[文献出处]:甘肃农业大学2011年