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地方鸭种遗传多样性分析及家鸭线粒体DNAD-环序列特征探讨

吴震洋

  本学位论文包括两部分研究内容。(1)地方鸭群体遗传多样性分析。以来自3个国家(柬埔寨、老挝和埃及)的13个鸭群体为研究对象,选择18个微卫星座位分析了群体遗传多样性。主要指标包括等位基因数、平均有效等位基因数(Ne)、每个群体的杂合度、多态信息含量(PIC)、平均期望杂合度(He)、平均观察杂合度(Ho)和遗传距离。结果表明,13个群体具有较高的平均多态信息含量(PIC)、期望杂合度(He)和观察杂合度(Ho),分别是0.5762、0.6528和0.4049。哈代-温伯格检测表明,13个群体均不平衡,F-检测分析结果表明FST范围从0.062(APH08)到0.285(CAUD27),平均群体间分化系数为0.144。聚类分析表明柬埔寨5个群体(CKC、CSR、COD、CKP和CRK)聚为一类,埃及3个群体(EAG、EAF和ESH)聚为一类,老挝5个群体(LLG、LOD、LXK、LVC和LCP)聚为一类。不同群体的聚类关系和品种历史及分布相符合。在这些地方鸭群体中,18个微卫星座位适用于遗传分析。(2)家鸭线粒体DNA D-环序列特征分析。以4对位于D-环区不同位置的引物扩增和测定已知遗传背景的家鸭和番鸭以及未知遗传背景的家鸭。在家养瘤头鸭中,D-环区序列是同质的,而在家养野鸭中,序列则是异质的。结果表明,家养野鸭血液中存在起源于线粒体的核基因。这个现象未见前人的报道,并且影响用D-环序列作为分子标记对家鸭遗传多样性方面研究的应用。有关核内同源基因组织特异性和用特殊引物扩增真实D-环序列的方法建立,将有助于保证获得准确的家鸭遗传特性和种属鉴定。……   
[关键词]:;微卫星标记;遗传多样性;线粒体DNA;D-环
[文献类型]:硕士论文
[文献出处]:甘肃农业大学2011年