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苎麻微卫星引物开发

龙珠

  苎麻分子标记育种发展迅速,本研究采用核酸数据库搜索法与磁珠探针杂交富集法分离了41个苎麻微卫星序列。利用Primer premier5.0和SSRHunter1.3软件设计了41对苎麻微卫星引物。主要结果如下: 1.本研究从320条表达序列标签核酸数据库搜索,设计了相对应的微卫星引物。全面搜索NCBI中苎麻表达序列标签数据库,从320条表达序列中发现了19条符合选择标准含SSR序列,设计19对SSR引物。 2.实验中用到了生物素标记探针(AG)15来杂交扩增后的基因组片段,再用磁珠吸附的方法富集构建微卫星序列文库,最后对阳性克隆进行筛选,其中有300-700bp的克隆28个,可以作为测序目标,微卫星片段的含有率很高,但有6个克隆微卫星位点不符合引物设计的基本要求,没有设计出合适引物,所以开发了22对微卫星引物,开发效率也很理想。 在实验中使用了不同的方法来分离微卫星片段,虽然各个方法都有所收获但是并不精通,但总结出了几种方法的精华。……   
[关键词]:苎麻;微卫星;磁珠;基因文库
[文献类型]:硕士论文
[文献出处]:华中农业大学2011年