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牛LXRα、FIAF基因多态性及其与生长性状的相关性研究

李荣荣

  本研究采用DNA测序、PCR-SSCP和PCR-RFLP技术对LXRα和FIAF两个候选基因在鲁西牛、郏县红牛、渤海黑牛、秦川牛、南阳牛和青海牦牛6个群体中共373个个体的遗传多态性进行检测,并分析了鲁西牛和郏县红牛基因遗传变异与其生长性状间的相关性,结果如下: 1.牛LXRα基因遗传多态性分析 在上述6个牛群体上对LXRα基因编码区进行遗传多态性检测,结果发现4处SNPs:LXRα-I1基因座1028T>C、LXRα-E2基因座1514T>C、LXRα-E4基因座2929G>A和LXRα-I5基因座3493T>C(与NC_007313对照),其中1514T>C位属于天冬氨酸的同义突变,2929G>A位属于脯氨酸的同义突变。1028T>C和1514T>C两个位点在5个黄牛群体中属于中度多态,青海牦牛群体中属于低度多态;2929G>A和3493T>C两个位点在6个牛群体中均属于低度多态。 2.牛LXRα基因多态性与其生长性状间的关联分析 牛LXRα基因遗传变异与鲁西牛和郏县红牛的体高、体重、体斜长等生长性状进行关联分析。对于LXRα-I1基因座,鲁西牛群体体高指标上TC基因型显著高于CC基因型(P<0.05),体斜长指标上TC基因型极显著高于CC基因型(P<0.01);郏县红牛群体不同基因型对生长性状的影响不显著(P>0.05)。对于LXRα-E2基因座,鲁西牛群体体高指标上TT基因型显著高于TC基因型(P<0.05);郏县红牛群体体高、体斜长和腰角宽指标上TT基因型极显著高于TC基因型(P<0.01),体重、胸围和腹围指标上TT基因型显著高于TC基因型(P<0.05)。对于LXRα-E4基因座,鲁西牛群体十字部高指标上GA基因型显著高于GG基因型(P<0.05);郏县红牛群体不同基因型在各指标间差异不显著。对于LXRα-I5基因座,鲁西牛群体除坐骨端宽外的指标上TT基因型均显著高于CC基因型,这个结论有待进一步考证;郏县红牛群体不同基因型对各项指标差异不显著。 3.牛FIAF基因遗传多态性分析 应用PCR-SSCP和DNA测序技术在6个牛群体上FIAF基因编码区进行遗传多态性检测,结果发现3处SNPs:FIAF-E3基因座1422 T>C,属于亮氨酸>脯氨酸的错义突变;FIAF-E5基因座4899 C>T,属于丝氨酸的同义突变;FIAF-E6基因座5095 T>A,属于精氨酸的同义突变(对照NC_007305)。其中1422 T>C位点仅鲁西牛和秦川牛群体属于中度多态,4899 C>T和5095 T>A两个位点在6个牛群体中均处于低度多态。 4.牛FIAF基因多态性与其生长性状间的关联分析 牛FIAF基因遗传变异与鲁西牛和郏县红牛的体高、体重、体斜长等生长性状进行关联分析。对于FIAF-E3基因座,鲁西牛群体体斜长、腰角宽和十字部高指标上TT基因型显著高于CC基因型(P<0.05);郏县红牛群体在各项生长性状指标上差异都不显著。对于FIAF-E5和FIAF-E6基因座,鲁西牛和郏县红牛群体不同基因型对其生长性状的贡献差异不显著。……   
[关键词]:;LXRα基因;FIAF基因;遗传多态性;关联分析
[文献类型]:硕士论文
[文献出处]:西北农林科技大学2011年