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广东鲂遗传多样性研究

吴茜

  广东鲂(Megalobrama terminalis),又称三角鲂,属于鲤科,鲌亚科,鲂属。广东鲂属于短距离洄游、有固定产卵场、聚群产卵的鱼类,仅分布于广东、广西和海南省。广东鲂体型中等,是珠江水系重要的经济鱼类。本实验采用随机扩增多态性(RAPD)分析及形态学测量、线粒体COI基因分析为实验手段,对其进行遗传多样性分析,以了解其遗传多样性状况,为广东鲂的种质保护和增殖放流做基础。主要结果和结论如下: 1.随机扩增多态性(RAPD)分析: 运用RAPD技术,对广东鲂遗传多样性进行研究。其结果显示:共筛选出14条引物扩增出158条带谱,其中多态性条带数为39条,占24.6%;每个引物扩增产生的条带数为7~16条,扩增片段主要分布在100bp~2000bp之间;分析结果表明,罗旁产卵场个体间的平均遗传距离为0.070,青皮塘产卵场的平均遗传距离为0.075,两个产卵场之间的遗传距离为0.086,大于群体内的遗传距离。相比于其他鲌亚科的鱼类,广东鲂的遗传多样性处于中等水平,聚类分析的结果显示广东鲂有7个群体但并不以地理聚群,这可能与不同群体的广东鲂所选择的产卵场相关。 2. COI基因序列分析 1.通过对广东鲂的形态学和线粒体COI基因642bp片段序列比对,珠江广东鲂的遗传多样性进了分析。研究结果显示,在测定的278个样品中,共定义了24个单倍型(H1-H24),发现45个变异位点,其中12个简约位点,碱基含量A、T、C、G含量分别为:26.45%,28.13%,17.48%,27.94%,A+T含量54.58%,G+C含量45.42%,A+T﹥G+C;变异位点均为转换,无颠换;个体平均单倍型多样性为0.758,平均核苷酸多样性为0.00233,24种单倍型遗传距离0.0016~0.0594。个体间平均的遗传距离为0.0024,而群体间的平均遗传距离为0.0090,群体内遗传多样性东江群体最低,梧州群体最高;遗传多样性整体来说处于中等水平,由于其较高的单倍型多样性和较低的核苷酸多样性,有很多单倍型的样品含量很少,说明其种质资源保护还是十分必要的。 3.种群形态学差异分析 对广东鲂的形态学可量形状和框架结构进行测量,并进行主成分分析和降维分析。结构表明:主成分分析散点图显示,虽然并没有把5个地理群体的广东鲂区分开,但已经有分离的趋势;再对其进行降维分析,结果显示广东鲂的形态学测量参数(h,BD,HI)与其形态的差异有较大关联,而且这几个参数与COI基因测序结果相一致。 4.综合分析 RAPD和COI基因片段对罗旁和青皮塘两个产卵场的广东鲂进行分析,两种分析方法聚类结果相近,均有2个较大分支和几个较小分支,并且不以地理聚群,不同群体的广东鲂有自己选择的产卵场;广东鲂的形态学测量结果与基因测序分析结果相似,不同地方采获鱼类,具有丰富的多态性位点。碱基位点上的变化尚不能在直接对应在形态差异上,但形态学数据分析表明,广东鲂显示不同地理聚群的趋势;广东鲂的遗传多样性一般丰富,但种群多态性均处于较低水平;Taima’s D呈负值且极显著(0<P<0.10),表明广东鲂历史上进行过种群扩张。……   
[关键词]:广东鲂;RAPD;COI基因;形态学测量;遗传多样性
[文献类型]:硕士论文
[文献出处]:上海海洋大学2011年