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花生条纹病毒分子变异分析和马铃薯Y病毒蛋白的表达纯化

侯珊珊

  山东是我国花生生产和出口大省,常年种植面积大约1300万亩。花生病毒的发生严重制约着花生产量和品质的提高,进而影响了花生的生产和出口创汇。 本研究用RT-PCR方法从2008年-2009年在山东各地采集的153个疑似病毒病的花生样品中,检测到花生条纹病毒(Peanut stripe virus, PStV)、黄瓜花叶病毒(Cucumber mosaic virus, CMV)和花生斑驳病毒(Peanut mottle virus, PeMoV)三种病毒。其中PStV的发生最广,在山东各花生产区均有发生,检出率最高为48.4%。其次为CMV, CMV检出率为19.0%。CMV与PStV多复合侵染,复合侵染率为9.2%。PeMoV仅在青岛地区发现。 扩增了74个PStV分离物基因组3′-端1082 bp的片段。该片段包括部分NIb编码序列(129 bp),完整的外壳蛋白(coat protein, CP)编码序列(864 bp)和3′端非编码序列(89 bp)。序列分析发现,74个PStV山东分离物CP基因核苷酸一致率为98.0%~100%,氨基酸一致率为98.3%~100%,与其它36个分离物的核苷酸和氨基酸一致率分别为93.5%~100%和92.0%~100%。系统进化分析表明,PStV分离物可以分为和地理来源相关的两个组:第I组包括美国、中国和印尼分离物,其中美国和中国大陆分离物形成IA亚组,印尼分离物属于IB亚组;第II组主要由越南、泰国和中国台湾的分离物组成。种群统计分析显示,同一国家的PStV种群基因交流频繁,而不同国家的PStV种群间基因交流不频繁;PStV种群在中国呈扩张趋势。 根据PStV、CMV和PeMoV基因组特点,构建了针对这三种病毒的RNAi植物表达载体。 本研究成功表达了马铃薯Y病毒(Potato virus Y,PVY)11个蛋白中的10个,用于蛋白的功能和晶体结构的研究。……   
[关键词]:花生;花生条纹病毒;分子变异;群体结构;蛋白表达
[文献类型]:硕士论文
[文献出处]:山东农业大学2011年