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牦牛钙激活蛋白酶(CAPN1)基因多态性与肉质性状的相关性研究

吴孝杰

   本研究选取2岁(51头)、3岁(59头)、4岁(71头)共181头牦牛,取其背最长肌分别成熟0、1、3、7、14、21天,测定每头牦牛各个成熟期的剪切力、蒸煮损失、熟肉损失、失水率和PH值,每个年龄段随机取20头牦牛测定各个成熟期的蛋白含量、水分含量和脂肪含量。同时设计4对引物,采用PCR-SSCP结合DNA测序技术,对牦牛CAPN1基因进行单核苷酸多态性检测,探讨CAPN1基因的遗传多态性。并对各多态位点与不同年龄段牦牛宰后成熟过程的肉质特性进行关联分析,初步揭示具有不同遗传基础的牦牛遗传和非遗传因素互作的规律,为进一步研究牦牛CAPN1基因的调控机理奠定基础,同时为牦牛选育提供分子遗传学理论依据。结果如下: 1、PCR-SSCP检测结果显示:3F、4F、5F和6F均存在多态性。3F在12内含子上发现一个G/A突变,该位点基因A的基因频率为0.6989,优势基因型为AA,基因型频率为0.4751。4F在13内含子存在一个G/A变异,基因型BB为优势基因型,基因型频率为0.3923,杂合体AB的基因型频率达到0.3978。5F在第9内含子检测到G/T的变异位点,基因型AA为优势基因型,频率为0.8287。6F在第11外显子处存在A/G突变,引起了第411位的天冬酰胺(N)→天冬氨酸(D)的变化,为错义突变。 2、遗传学分析得知:3F、4F位点杂合度较大分别为0.4209、0.4834,两个位点均属于中度多态,而5F、6F杂合度分别为0.1657、0.2009,均属于低度多态。除4F位点处于非HARDY-WEINBERG平衡状态外,其他三个位点均处于HARDY-WEINBERG平衡状态。 3、3F与成熟时间对脂肪含量存在极显著互作效应。在成熟0,3,7,14和21天时,三种基因型个体之间的脂肪含量没有显著性差异;在成熟1天时,BB型个体的脂肪含量显著高于AA和AB型。 4、4F位点与失水率有极显著关联,AA型个体的失水率显著小于BB型和AB型。4F与年龄对粗脂肪存在显著互作效应,结果表明,3岁牦牛中,基因型AA的粗脂肪含量显著高于基因型BB、AB。4F与成熟时间对熟肉损失存在极显著互作效应。结果表明,在成熟0,1,3和21天时,三种基因型之间的熟肉损失没有显著性差异;在成熟7天时,AA型个体的熟肉损失显著小于AB型个体,而与BB型差异不显著:在成熟14天时,AB型个体的熟肉损失显著小于BB型,而与AA型差异不显著。 5、5F位点与剪切力和粗脂肪含量有显著关联,AA型个体的剪切力和粗脂肪含量均显著低于AB型个体。但同时存在5F基因型×成熟天数、5F基因型×成熟天数×年龄的互作效应,以及5F基因型×年龄对粗脂肪含量的互作效应。 6、6F位点与蛋白含量有极显著关联,AB型个体的蛋白含量显著高于AA型。6F与屠宰年龄对熟肉损失存在极显著互作效应。2岁和4岁年龄组中,两种基因型之间的熟肉损失无显著性差异;3岁年龄组中,AB型个体的熟肉损失显著小于AA型。……   
[关键词]:钙激活蛋白酶基因;多态性;肉质性状;关联性分析
[文献类型]:硕士论文
[文献出处]:甘肃农业大学2010年