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6个绵羊类群Callipyge和CAPN1基因多态性及其与生长性状的相关性研究

刘晓敏

  本研究以欧拉型藏羊、甘加型藏羊、乔科型藏羊、陶塞特羊、德国美利奴和小尾寒羊6个绵羊类群共计404个个体为研究对象,利用PCR-SSCP技术,对Callipyge基因包括CLPGSNP位点的序列和CAPN1基因部分序列进行多态性检测,探讨这两个候选基因在6个类群中的遗传多态性,并利用最小二乘线性模型分析其与生长性状(体重、体长、体高、胸围和胸深)的相关性,为绵羊选育提供分子遗传学理论依据。结果如下: 1、对Callipyge基因P引物PCR-SSCP检测结果表明:6个绵羊类群中共检测到AA、AB和BB三种基因型,均以AA型为优势等位基因型,A为优势等位基因。测序结果显示在扩增片段的176bp处存在一个C→T的突变。 2、对CAPN1基因Ll引物PCR-SSCP检测结果表明:6个绵羊类群中均检测到AA、BB和AB三种基因型,除陶塞特羊中A为优势等位基因,其余类群B为优势等位基因,测序结果显示CAPN1-L1扩增片段的190bp存在一个A→G突变,位于第5内含子,260bp处存在一个A→G突变,位于第6外显子,且该突变没有引起氨基酸的突变,属于同义突变。 3、对CAPN1基因L2引物PCR-SSCP检测表明:6个绵羊类群中共检测到AA、BB、CC、AB、AC和BC 6种基因型,但仅在欧拉羊中检测到CC基因型,均以A为优势等位基因。测序结果显示在扩增片段的21bp处发生一个A→G、24bp处发生一个T→C、42bp处发生一个G→A、122bp处发生一个G→A、146bp处发生一个C→T的突变,后两个突变位于第9外显子,但没有引起氨基酸的突变,为同义突变。 4、遗传特性分析得知:6个绵羊类群中Callipyge基因所检测的多态位点杂合度较低,属低度多态,X2适合性检验表明除小尾寒羊外,其余群体均处于Hardy-Weinberg平衡(P>0.05)状态。6个绵羊类群中CAPN1基因中所检测的CAPN1-L1和CAPN1-L2多态位点杂合度较高,均属中度多态,X2适合性检验表明:陶塞特羊在所检测的L1和L2多态位点处均处于Hardy-Weinberg非平衡(P<0.05)状态,其余绵羊类群均处于Hardy-Weinberg平衡状态(P>0.05)。 5、利用最小二乘线性模型进行多态位点与生长性状相关性分析,结果表明:Callipyge基因所检测的多态位点与生长性状没有显著相关。CAPN1-L1所检测的多态位点中欧拉羊AB基因型胸深性状指标显著高于BB基因型(P<0.05),而陶塞特羊BB基因型胸深性状指标显著高于AB基因型(P<0.05);CAPN1-L2所检测的多态位点与生长性状没有显著相关。……   
[关键词]:Callipyge基因;CAPN1基因;多态性;生长性状;相关性
[文献类型]:硕士论文
[文献出处]:甘肃农业大学2010年