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甘肃高山细毛羊KRT-IF基因克隆、生物信息学分析及其遗传效应研究

王丽萍

   本研究以甘肃高山细毛羊为研究对象,应用基因克隆、生物信息学、PCR-SSCP和HRM技术,克隆甘肃高山细毛羊KRT-IF 35基因,进行生物信息学分析,分析KRT-IF 35、KRT-IF 31基因的遗传效应及其与毛用性状的相关性,实验所获得结果如下: 1.首次克隆出绵羊KRT-IF 35基因,并对其进行生物信息学分析。绵羊KRT-IF 35基因全长4414bp (NCBI No:GU456629), CDS区全长1751bp;KRT-IF 35蛋白由455个氨基酸编码,存在两个跨膜区,二级结构以螺旋为主,且其存在1个结构域,为亲水性蛋白。 2.经PCR-SSCP分析和测序分析,KRT-IF 35 CDS区第145碱基处发生C→T的突变,产生一对等位基因A,B,存在AA、AB、BB三种基因型。AA基因型为细毛型、超细型品系的优势基因型;A等位基因为细毛型、超细型品系的优势等位基因。AA、AB基因型细度差异显著;AA、BB基因型细度离散差异显著;AA、BB基因型弯曲差异显著,这三个品系均处于Hardy-weinberg动态平衡状态(P>0.05)。推测此位点可能是与影响羊毛细度、弯曲度、细度离散的一个主效基因或调控羊毛性状的基因紧密连锁的分子遗传标记。 3.经HRM分析和测序分析,在KRT-IF 31基因CDS区166位发生A-G突变,产生一对等位基因C,D,存在CC、CD、DD三种基因型。C等位基因为细毛型和超细型品系的优势等位基因,CC基因型为细毛型和超细型品系优势基因型,CD基因型为毛肉兼用型品系优势基因型,细毛型品系处于Hardy-weinberg动态平衡状态。CC、CD基因型细度差异显著;CC、DD基因型细度差异显著,因此此位点可能与羊毛细度有关。 4.KRT-IF 31基因CDS区191位发生T-C突变,产生一对等位基因E,F,存在EE、EF、FF三种基因型。E等位基因为细毛型、超细型和毛肉兼用型品系的优势等位基因,而EE基因型为细毛型和毛肉兼用型品系优势基因型;EF基因型为超细型品系优势基因型。细毛型品系处于Hardy-weinberg动态平衡状态(P>0.05)。EF、FF基因型细度差异显著;EE、EF基因型细度离散差异显著,因此此位点可能与羊毛细度,细度离散有关。……   
[关键词]:甘肃高山细毛羊;KRT-IF 35;KRT-IF 31;HRM生物信息学分析
[文献类型]:硕士论文
[文献出处]:甘肃农业大学2010年