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鸻形目12种鸟类线粒体ATP8+ATP6基因及其假基因的比较研究

崔博;马飞;李庆伟

  核基因组中的线粒体假基因(nucleal mitochondrial DNA segment,简称numt序列)目前在植物、昆虫和哺乳动物中的研究较为广泛,但关于鸟类核基因组numt序列的研究还十分有限。根据目前 GenBank登录的红原鸡核基因组草图与其线粒体基因组比对发现红原鸡核基因组中存在一些线粒体假基因,选择其中与线粒体基因组的部分ATP8和部分ATP6基因同源的片段作为目的基因。利用 PCR方法对鹆形目12种鸟类的线粒体ATP8+ATP6基因及其numt序列进行扩增和序列测定。结果表明:与线粒体基因相比numt序列的碱基替换速率很低,并且在进化中没有受到选择压力的影响, 各密码子发生替换的次数几乎相同,另外在进化过程中也没有明显的转换倾向性。利用线粒体基因及numt序列分别构建了鸻形目12种鸟类的系统发育树,初步认为由于numt序列进化速率很低,所以不适合属内各物种间的系统分类,但对于解决远源物种间的系统发育重建具有一定的重要作用。通过比较mtDNA与numt两种序列进行系统发育研究的结果,更能客观地反映物种的进化关系,也是对传统mtDNA方法的校验。……