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犬恶丝虫成虫miRNA的研究

付彦;吴徐行;杨德英;谢跃;古小彬;王淑贤;杨光友

  本研究利用Illumina高通量测序技术对犬恶丝虫(Dirofialria immitis)成虫小RNA进行测序,经过过滤,共得到9,860,038条小RNA序列,其中有2,667,079条(27.05%)能匹配上马来丝虫Brugiamalayi基因组。有1,836,109条(18.62%)小RNA序列代表miRNA,去除冗余序列,共得到4,432,9条(4.21%)独立的miRNA序列。通过与miRBase16.0中所有动物的miRNA前体/miRNA成熟序列进行比对,得到1063条已知miRNA序列。利用Mireap软件预测出14条新的候选miRNA。此外,还预测了候选miRNA和已知miRNA的靶基因,并利用Gene Ontology,KEGG对靶基因的基因功能和代谢通路等进行分析。……