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一株鼬獾狂犬病病毒的全基因组及主要结构蛋白序列分析

张守峰;刘晔;赵敬慧;张菲;王颖;张锦霞;扈荣良

  对2008年10月分离自江西景德镇地区的鼬獾狂犬病分离株JX08-45进行了全基因组和编码蛋白序列的测定和分析。结果显示,JX08-45分离株基因组全长11922nt,其3 端和5 端分别存在58nt的Leader和70nt的Trailer序列,且在两末端存在11bp的反向互补序列;基因组上依次存在核蛋白(N),磷酸化蛋白(P),基质蛋白(M),糖蛋白(G),转录酶大蛋白(L)5个结构蛋白基因,各基因编码区长度符合基因I型狂犬病毒(RABV)特征,但JX08-45全基因组较犬分离株短1-9碱基,系因各基因的3 -UTR碱基缺失长度不同所致。与中国境内犬源RABV分离株对比分析发现,JX08-45株糖蛋白基因编码的氨基酸序列表现出较大差异,其信号肽-7~-4位氨基酸存在2~3个连续氨基酸的差异;成熟肽存在6个犬流行株氨基酸残基罕见突变:V30M,S131P,L185S,S201F,D408N,A467P;跨膜区与部分犬源RV流行株存在氨基酸差异;但整个糖蛋白的主要抗原区、糖基化位点区氨基酸序列无差异。进化分析显示,JX08-45与其它鼬獾分离株在进化树上已形成独立的进化分支。以上说明,鼬獾狂犬病病毒在全基因组长度和结构蛋白氨基酸组成上具有典型的分子特征。……