手机知网 App
24小时专家级知识服务
打 开
手机知网|搜索

猪细小病毒主要非结构蛋白与结构蛋白的密码子偏爱性分析

赵武;李斌;梁家幸;梁保忠;姚瑞英;黄安国;何颖;蒋玉雯

  通过分析猪细小病毒(porcine parvovirus,PPV)主要非结构蛋白(non-structural protein,NS1)及结构蛋白(VP1、VP2)的密码子偏爱性,为三种蛋白基因表达中宿主系统的选择提供参考.运用EMBOSS(The European MolecularBiology Open Software Suite)的CHIPS(Codon Heterozygosity in a Protein Coding Sequence)和CUSP(Create a codonusage table)程序对PPV的NS1、VP1和VP2蛋白基因进行分析,并将分析结果与大肠杆菌、酵母及人的密码子偏爱性进行比较.结果显示,PPV NS1、VP1、VP2基因的Nc(Effective number of codons)值分别为39.696、36.638、36.482,表明三种蛋白存在较明显的密码子偏爱性,并且均偏爱选择第三位核苷酸为A的密码子.PPV三种蛋白与大肠杆菌、酵母及人的密码子偏爱性也有一定差异,其中与酵母的密码子偏爱性差异最小,其表达系统选择在酵母较为合适.……