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鸡GHR基因5′-侧翼区SNPs筛选

谢亮;欧阳建华;孙汉;张细权

  本文通过对 cGHR 基因5°-侧翼区的约3500 bp 序列进行 SNPs 筛选,获得若干新的 SNPs,并进一步获取这一区域的 SNP 图谱。选用红色原鸡(RJF)、杏花鸡(XH)、隐性白洛克鸡(WRR)、泰和丝羽乌骨鸡(TS)、莱航鸡(WL)和江西矮小鸡(SLD) 等6个地方品种作为试验材料,利用 DNA 池和直接测序技术进行 SNPs 筛选。结果如下:本试验共新发现 GHR 基因的 SNPs 27个,其中有颠换6个,转换21个,平均130 bp 有 1个 SNP,检出率为0.77%;还发现一个4 bp 的插入/缺失和一个7 bp 的插入/缺失。从本文的研究结果可知:SNPs 和插入/缺失在基因组中的产生决不是均匀分布的,有时存在较为明显的集中趋势。……