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20种金黄色葡萄球菌肠毒素基因进化分析

宋明辉;史贤明

  金黄色葡萄球菌肠毒素(SEs)是引发食物中毒最重要的致病因子之一,除了传统的SEA至SEE 5种血清型外,已有15种新型肠毒素被发现本研究从NCBI genbamk下载了20种肠毒素的CDS序列,使用clustalx和mega4.0进行了序列比对分析,发现氨基酸序列在30-140变异程度明显高于其它区段,该区段是肠毒素的β桶状结构的重要组成部分,cystine loop位于β桶状结构内,可能与肠毒素的催吐活性有关,本实验通过序列比对证实了20种肠毒素催吐活性的差异可能跟β桶状结构内的较大序列变异程度有关。本研究使用MRbayes3.12构建了20种肠毒素CDS序列进化树,并结合最大似然法(ML)和近邻法(NJ)验证了进化树的准确性。根据构建的进化树可以把20种肠毒素分成4组,其中SEI,SEL,SET,SEK,SEM和SEQ这一组肠毒素都没有cystine loop,SEI,SEL,SET和SEM经实验验证毒性较弱,SEK、SEQ尚待验证;食物中毒中经常发现的肠毒素比如SEA、SED等进化关系则很近。本研究为今后更系统深入的研究金黄色葡萄球菌肠毒素的多样性和它们致病变异规律提供了信息支持。……